RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514110.5

SNHG4-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 4, human

TSL 1 (best)

Gene SNHG4, Length 679 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG4-208	ENST00000514110	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	CD93	Q9NPY3	652 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	CISH	Q9NSE2	258 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	RAB20	Q9NX57	234 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	FBXO10	Q9UK96	956 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	WASH3P	C4AMC7	463 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	AP5Z1	O43299	807 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	CEACAM1	P13688	526 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	ENG	P17813	658 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	PRCP	P42785	496 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	RAB41	Q5JT25	222 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	FYB2	Q5VWT5	728 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	PIGZ	Q86VD9	579 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	DEFB124	Q8NES8	71 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	WASF3	Q9UPY6	502 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	TULP2	O00295	520 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	CETN3	O15182	167 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF217	O75362	1048 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	CFI	P05156	583 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	SPINK2	P20155	84 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	DPP6	P42658	865 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	COG7	P83436	770 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF33A	Q06730	810 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	FOXC1	Q12948	553 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	CBWD6	Q4V339	395 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	DENND1C	Q8IV53	801 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	TTC39C	Q8N584	583 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	USP24	Q9UPU5	2620 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	SLC12A8	A0AV02	714 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	GFRA2	O00451	464 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	STX10	O60499	249 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	HOXD12	P35452	270 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	TKTL1	P51854	596 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	MFAP3	P55082	362 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	12.8	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	GEN1	Q17RS7	908 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	DCLK3	Q9C098	648 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	CAPN10	Q9HC96	672 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	ZBED1	O96006	694 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	SERPINF2	P08697	491 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	CHKA	P35790	457 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	IL12RB1	P42701	662 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	PDE4C	Q08493	712 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	SEMA3B	Q13214	749 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	CUL2	Q13617	745 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	FUT11	Q495W5	492 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SNHG4-208	ENST00000514110	PIP4P1	Q86T03	277 aa		12.79	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms