RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 MAP3K7CLP57077 242 aa11.21□□□□□ -0.61
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SH3BP2-209ENST00000504450 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-209ENST00000504450 HIF1AQ16665 826 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-209ENST00000504450 SKIDA1Q1XH10 827 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-209ENST00000504450 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-209ENST00000504450 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-209ENST00000504450 C4orf22Q6V702 233 aa11.19□□□□□ -0.62
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SH3BP2-209ENST00000504450 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa11.19□□□□□ -0.62
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