RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496325.5

PRKCZ-222, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 4

Gene PRKCZ, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-222	ENST00000496325	MIB1	Q86YT6	1006 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	SCML4	Q8N228	414 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	CPA6	Q8N4T0	437 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	EDEM1	Q92611	657 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	MIS12	Q9H081	205 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	ST7	Q9NRC1	585 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	SPEG	Q15772	3267 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	NCAM2	O15394	837 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	TEX33	O43247	280 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	CYP17A1	P05093	508 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	HOXC13	P31276	330 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	GALK1	P51570	392 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	16.59	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	UBXN1	Q04323	297 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	DMWD	Q09019	674 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	DHCR24	Q15392	516 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	MEA1	Q16626	185 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	HTR3D	Q70Z44	454 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	PASD1	Q8IV76	773 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	STK33	Q9BYT3	514 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	CBX8	Q9HC52	389 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	EML5	Q05BV3	1969 aa		16.58	■□□□□ 0.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	16.58	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	STC2	O76061	302 aa		16.58	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	NFATC1	O95644	943 aa		16.58	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	RET	P07949	1114 aa		16.58	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	HMBS	P08397	361 aa		16.58	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	GAS6	Q14393	721 aa		16.58	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	16.58	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		16.58	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		16.58	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		16.58	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		16.58	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	STK32A	Q8WU08	396 aa		16.58	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		16.58	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		16.58	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		16.58	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	RAB23	Q9ULC3	237 aa		16.58	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325		E5RJQ4	531 aa		16.57	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325		F8VZ95	297 aa		16.57	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	16.57	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	16.57	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	HR	O43593	1189 aa		16.57	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	KLKB1	P03952	638 aa		16.57	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	FYN	P06241	537 aa		16.57	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	OPRD1	P41143	372 aa		16.57	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	JAM2	P57087	298 aa		16.57	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	NR1H3	Q13133	447 aa		16.57	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	CCIN	Q13939	588 aa		16.57	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	CSRP2	Q16527	193 aa		16.57	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		16.57	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	16.57	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMEM110	Q86TL2	294 aa		16.57	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		16.57	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	16.57	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	16.57	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	16.57	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	16.57	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		16.57	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		16.57	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		16.57	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		16.57	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC12A8	A0AV02	714 aa		16.56	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM170A	A1A519	330 aa		16.56	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZZEF1	O43149	2961 aa		16.56	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	GFPT2	O94808	682 aa		16.56	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	FBXO21	O94952	628 aa		16.56	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	EGF	P01133	1207 aa		16.56	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	LTF	P02788	710 aa		16.56	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	CYP11B1	P15538	503 aa		16.56	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	KRT9	P35527	623 aa		16.56	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	ACADSB	P45954	432 aa		16.56	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC6A11	P48066	632 aa		16.56	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	BPIFB4	P59827	614 aa		16.56	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	SATB1	Q01826	763 aa		16.56	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	PDCL	Q13371	301 aa		16.56	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		16.56	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	TAF3	Q5VWG9	929 aa		16.56	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325		Q6ZNB5	142 aa		16.56	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325		Q6ZS52	159 aa		16.56	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	16.56	■□□□□ 0.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	LUZP1	Q86V48	1076 aa		16.56	■□□□□ 0.24

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