RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494241.5

ZNF638-225, Transcript of zinc finger protein 638, human

TSL 3

Gene ZNF638, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF638-225	ENST00000494241	CFHR1	Q03591	330 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	BFSP2	Q13515	415 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	CLCA1	A8K7I4	914 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	RRH	O14718	337 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	APAF1	O14727	1248 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	APOL1	O14791	398 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	INPPL1	O15357	1258 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	CTSA	P10619	480 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	MYL4	P12829	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	THBS4	P35443	961 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	AWAT2	Q6E213	333 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	BEND5	Q7L4P6	421 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	SARG	Q9BW04	601 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	TLR2	O60603	784 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	CBFA2T3	O75081	653 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	CPA2	P48052	419 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	VPS41	P49754	854 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	STIM1	Q13586	685 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	CNGA3	Q16281	694 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	WDR24	Q96S15	920 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241		A0A1W2PPC4	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	PMM2	O15305	246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	KCNQ3	O43525	872 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	NDST3	O95803	873 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	PLAU	P00749	431 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	MYL3	P08590	195 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	ITGB6	P18564	788 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	MST1	P26927	711 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	HSF1	Q00613	529 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	DEF8	Q6ZN54	512 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63	9e-7	■■□□□ 12.7
ZNF638-225	ENST00000494241	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	SNX27	Q96L92	541 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	FCRL5	Q96RD9	977 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	CD63	P08962	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	IDE	P14735	1019 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	MTA1	Q13330	715 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	FHL1	Q13642	323 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	PIP4P1	Q86T03	277 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	PIGK	Q92643	395 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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