RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493752.5

ABCD4-216, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 3

Gene ABCD4, Length 719 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-216ENST00000493752 SDC4P31431 198 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 FLT3P36888 993 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 MAGEA1P43355 309 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 PTPN9P43378 593 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 HARS2P49590 506 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 KRT83P78385 493 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 RING1Q06587 406 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 FCHO2Q0JRZ9 810 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 MTA1Q13330 715 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 NNTQ13423 1086 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 TCEAL1Q15170 157 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 ZNF77Q15935 545 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 CCDC14Q49A88 953 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 VITQ6UXI7 678 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 RAD9BQ6WBX8 426 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 HTR3DQ70Z44 454 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 DNAAF5Q86Y56 855 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 UNC45BQ8IWX7 931 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 GJD3Q8N144 294 aa8.48□□□□□ -1.05
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ABCD4-216ENST00000493752 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 FNIP1Q8TF40 1166 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 RXFP2Q8WXD0 754 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 AZIN2Q96A70 460 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 ZNF653Q96CK0 615 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 RSPRY1Q96DX4 576 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 SERPINB11Q96P15 392 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 DCLK3Q9C098 648 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 SMPD4Q9NXE4 827 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 CFAP97Q9P2B7 532 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 TBC1D14Q9P2M4 693 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 RASAL2Q9UJF2 1139 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 TLR6Q9Y2C9 796 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 ZNF510Q9Y2H8 683 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 SCINQ9Y6U3 715 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 PTPRDP23468 1912 aa8.48□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 M0QYT0 321 aa8.47□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 CHADO15335 359 aa8.47□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 ARHGAP6O43182 974 aa8.47□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 NRDCO43847 1150 aa8.47□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 GREM1O60565 184 aa8.47□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 STC2O76061 302 aa8.47□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 IGLV3-27P01718 113 aa8.47□□□□□ -1.05
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ABCD4-216ENST00000493752 CXCR3P49682 368 aa8.47□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 TBX4P57082 545 aa8.47□□□□□ -1.05
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ABCD4-216ENST00000493752 MTF1Q14872 753 aa8.47□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 PDGFRLQ15198 375 aa8.47□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa8.47□□□□□ -1.05
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ABCD4-216ENST00000493752 TRNP1Q6NT89 227 aa8.47□□□□□ -1.05
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ABCD4-216ENST00000493752 TAC4Q86UU9 113 aa8.47□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 RNF135Q8IUD6 432 aa8.47□□□□□ -1.05
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ABCD4-216ENST00000493752 SLC39A13Q96H72 371 aa8.47□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 CFAP57Q96MR6 1250 aa8.47□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 MCEEQ96PE7 176 aa8.47□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 KXD1Q9BQD3 176 aa8.47□□□□□ -1.05
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ABCD4-216ENST00000493752 FAM204AQ9H8W3 233 aa8.47□□□□□ -1.05
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ABCD4-216ENST00000493752 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
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ABCD4-216ENST00000493752 UVRAGQ9P2Y5 699 aa8.47□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 MYO1AQ9UBC5 1043 aa8.47□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 LCMT1Q9UIC8 334 aa8.47□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
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ABCD4-216ENST00000493752 NOTCH4Q99466 2003 aa8.46□□□□□ -1.05
ABCD4-216ENST00000493752 KCNU1A8MYU2 1149 aa8.46□□□□□ -1.06
ABCD4-216ENST00000493752 MYO1FO00160 1098 aa8.46□□□□□ -1.06
ABCD4-216ENST00000493752 IRAK2O43187 625 aa8.46□□□□□ -1.06
ABCD4-216ENST00000493752 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
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