RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492717.1

DCTN1-222, Transcript of dynactin subunit 1, human

TSL 2

Gene DCTN1, Length 371 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN1-222	ENST00000492717	CCDC169	A6NNP5	214 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717		K7ERI5	159 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	EPHB6	O15197	1021 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	P4HA2	O15460	535 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	B4GALT5	O43286	388 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	EXTL3	O43909	919 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	CHRNA1	P02708	482 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	LTF	P02788	710 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	CKB	P12277	381 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	ACTN1	P12814	892 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	TMOD1	P28289	359 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	FMO5	P49326	533 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	SCAND1	P57086	179 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	PHC1	P78364	1004 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	CCZ1B	P86790	482 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	IRF9	Q00978	393 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	CYP24A1	Q07973	514 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	PPP3CA	Q08209	521 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	TFDP1	Q14186	410 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	PSMD6	Q15008	389 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	TERF2	Q15554	542 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	RAB30	Q15771	203 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	MEA1	Q16626	185 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	MAPK6	Q16659	721 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	CBWD6	Q4V339	395 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	EPC2	Q52LR7	807 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	XKR4	Q5GH76	650 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	UBXN11	Q5T124	520 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	CEP68	Q76N32	757 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717		Q7L0L9	218 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM228A	Q86W67	206 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	OSTM1	Q86WC4	334 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	GPD1L	Q8N335	351 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	SVIP	Q8NHG7	77 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	GBF1	Q92538	1859 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	IQCD	Q96DY2	449 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	NLRP4	Q96MN2	994 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	CDT1	Q9H211	546 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	KCND1	Q9NSA2	647 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	STOML1	Q9UBI4	398 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	INVS	Q9Y283	1065 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	TTC26	A0AVF1	554 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	C7orf72	A4D263	438 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717		H3BS24	57 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	N4BP3	O15049	544 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	OGT	O15294	1046 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	INPPL1	O15357	1258 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	CREB3	O43889	395 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	MFAP3L	O75121	409 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	SERPINC1	P01008	464 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	MCF2	P10911	925 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	6.11	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	AXL	P30530	894 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	GTF2H1	P32780	548 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	KLK7	P49862	253 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	CYP2J2	P51589	502 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	CLCN7	P51798	805 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	JAM2	P57087	298 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	DLG4	P78352	724 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	TRIM14	Q14142	442 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	6.11	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	ACAP2	Q15057	778 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	ZACN	Q401N2	412 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DCTN1-222	ENST00000492717	GPR158	Q5T848	1215 aa		6.11	□□□□□ -1.43

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