RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491240.5

RBM3-211, Transcript of RNA binding motif protein 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM3, Length 951 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM3-211ENST00000491240 ENGASEQ8NFI3 743 aa17.11■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 ULBP1Q9BZM6 244 aa17.11■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 MARK1Q9P0L2 795 aa17.11■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 TSPAN16Q9UKR8 245 aa17.11■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 CYP8B1Q9UNU6 501 aa17.11■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 PIK3R2O00459 728 aa17.1■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 SMC2O95347 1197 aa17.1■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 CISD3P0C7P0 127 aa17.1■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 NDUFV2P19404 249 aa17.1■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 ITPKAP23677 461 aa17.1■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 LYSMD4Q5XG99 296 aa17.1■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 ARHGAP17Q68EM7 881 aa17.1■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 SDE2Q6IQ49 451 aa17.1■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 TADA2BQ86TJ2 420 aa17.1■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 ANKRD52Q8NB46 1076 aa17.1■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 GSDMAQ96QA5 445 aa17.1■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 CLIC5Q9NZA1 410 aa17.1■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 MARCH2Q9P0N8 246 aa17.1■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 CLEC4EQ9ULY5 219 aa17.1■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 CFIP05156 583 aa17.09■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 CD44P16070 742 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 COG7P83436 770 aa17.09■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 ADIGQ0VDE8 80 aa17.09■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 GEN1Q17RS7 908 aa17.09■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 SGO2Q562F6 1265 aa17.09■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 TTC39CQ8N584 583 aa17.09■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 EDEM1Q92611 657 aa17.09■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 LRRC4Q9HBW1 653 aa17.09■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 TMEM9BQ9NQ34 198 aa17.09■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa17.09■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 MAN1B1Q9UKM7 699 aa17.09■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 STARD13Q9Y3M8 1113 aa17.09■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 PI4KAP42356 2102 aa17.08■□□□□ 0.33
RBM3-211ENST00000491240 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 TSPAN3O60637 253 aa17.08■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 KRT37O76014 449 aa17.08■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 ZBED1O96006 694 aa17.08■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 LCP1P13796 627 aa17.08■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 RGS7P49802 495 aa17.08■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 SLC8A3P57103 927 aa17.08■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 BECN1Q14457 450 aa17.08■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 CCDC40Q4G0X9 1142 aa17.08■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 RAB41Q5JT25 222 aa17.08■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa17.08■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa17.08■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 FYB2Q5VWT5 728 aa17.08■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 CACUL1Q86Y37 369 aa17.08■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 KCNV2Q8TDN2 545 aa17.08■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 KAT5Q92993 513 aa17.08■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 SLC35C1Q96A29 364 aa17.08■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 HESX1Q9UBX0 185 aa17.08■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 STRIP2Q9ULQ0 834 aa17.08■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 COQ4Q9Y3A0 265 aa17.08■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 CEP192Q8TEP8 1941 aa17.08■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa17.08■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa17.07■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 BIN1O00499 593 aa17.07■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 FMO5P49326 533 aa17.07■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 BCAT1P54687 386 aa17.07■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 MFAP3P55082 362 aa17.07■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 TMEM270Q6UE05 265 aa17.07■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 BHLHA9Q7RTU4 235 aa17.07■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 SYT12Q8IV01 421 aa17.07■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 FMNL3Q8IVF7 1028 aa17.07■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 ARHGAP18Q8N392 663 aa17.07■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 DDI1Q8WTU0 396 aa17.07■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 SORCS1Q8WY21 1168 aa17.07■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 TFAP2BQ92481 460 aa17.07■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa17.07■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 STON1Q9Y6Q2 735 aa17.07■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 ACACBO00763 2458 aa17.07■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 CACNA1BQ00975 2339 aa17.07■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 YJEFN3A6XGL0 299 aa17.06■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 E7ENQ6 273 aa17.06■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 PSMA7O14818 248 aa17.06■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 AP5Z1O43299 807 aa17.06■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 MSI1O43347 362 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 PENKP01210 267 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 ENGP17813 658 aa17.06■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 SPINK2P20155 84 aa17.06■□□□□ 0.32
RBM3-211ENST00000491240 PMLP29590 882 aa17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms