RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489318.1

C9orf3-220, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-220ENST00000489318 RUNDC3BQ96NL0 473 aa11.95□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 SERPINB11Q96P15 392 aa11.95□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 AP1M1Q9BXS5 423 aa11.95□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa11.95□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 FAM204AQ9H8W3 233 aa11.95□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 CYP4F11Q9HBI6 524 aa11.95□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP11.95□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 DDIT4Q9NX09 232 aa11.95□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa11.95□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 MTUS1Q9ULD2 1270 aa11.95□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 HELZP42694 1942 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 GRXCR1A8MXD5 290 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 I6L893 689 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 DYNC1I1O14576 645 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 TJP3O95049 919 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 MYOGP15173 224 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 IL4RP24394 825 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 L1CAMP32004 1257 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 GBP1P32455 592 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 TUBP50607 506 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 CDH6P55285 790 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 ADCY2Q08462 1091 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 PPP2R5DQ14738 602 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 BRMS1LQ5PSV4 323 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 SLC9A4Q6AI14 798 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 C8orf74Q6P047 294 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 SCYL2Q6P3W7 929 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 KCTD6Q8NC69 237 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 GPR152Q8TDT2 470 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 CASP10Q92851 521 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 PSMG2Q969U7 264 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 SLC39A13Q96H72 371 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 HOMER3Q9NSC5 361 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 PCYOX1Q9UHG3 505 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 ASB3Q9Y575 518 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 V9GYY5 206 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 HIDE1A8MVS5 230 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 H3BNC9 293 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 GRM6O15303 877 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 CXCL14O95715 111 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 IGLV3-27P01718 113 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 APOC2P02655 101 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 TUBBP07437 444 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 RARGP13631 454 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 KRT10P13645 584 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 ELF1P32519 619 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 BMP8BP34820 402 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 ADRA1BP35368 520 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 ALDH1A3P47895 512 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 PPP3CCP48454 512 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 CLCN4P51793 760 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 TWF1Q12792 350 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 NME3Q13232 169 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 VEPH1Q14D04 833 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 CCNG2Q16589 344 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 ARL13BQ3SXY8 428 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 ODF2Q5BJF6 829 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 EFHC2Q5JST6 749 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 WDR93Q6P2C0 686 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 TTC27Q6P3X3 843 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 KLHDC10Q6PID8 442 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 CCDC149Q6ZUS6 474 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 ADAM32Q8TC27 787 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 GIPC2Q8TF65 315 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 RNF139Q8WU17 664 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 RNF157Q96PX1 679 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 KRT12Q99456 494 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 LRRC1Q9BTT6 524 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 PBX4Q9BYU1 374 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 DCLK3Q9C098 648 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 ANLNQ9NQW6 1124 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 RAB21Q9UL25 225 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 TLR6Q9Y2C9 796 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
C9orf3-220ENST00000489318 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms