RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482651.5

HDGF-208, Transcript of heparin binding growth factor, human

TSL 3

Gene HDGF, Length 966 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDGF-208	ENST00000482651	TERF2	Q15554	542 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	VWA3B	Q502W6	1294 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	DRC7	Q8IY82	874 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	FUK	Q8N0W3	1084 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	KRT222	Q8N1A0	295 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	NUP93	Q8N1F7	819 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	NELL1	Q92832	810 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	EBF3	Q9H4W6	596 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	COMMD8	Q9NX08	183 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	CBFA2T2	O43439	604 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	OLFM2	O95897	454 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	TUBB4A	P04350	444 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	TDGF1	P13385	188 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	CCDC130	P13994	396 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	IFNAR2	P48551	515 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	FMO5	P49326	533 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	SLC5A3	P53794	718 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	SLC7A9	P82251	487 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	AMPD2	Q01433	879 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	TAF10	Q12962	218 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	CCIN	Q13939	588 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	PPP2R5D	Q14738	602 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	PON2	Q15165	354 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	GBP6	Q6ZN66	633 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	CPA6	Q8N4T0	437 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	TTC39C	Q8N584	583 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	ZNF511	Q8NB15	262 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	ATP2A3	Q93084	1043 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	FBXO32	Q969P5	355 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	SLC35C1	Q96A29	364 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	TWNK	Q96RR1	684 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	KCNK16	Q96T55	309 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	SMO	Q99835	787 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	C12orf49	Q9H741	205 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	KRT82	Q9NSB4	513 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	IL37	Q9NZH6	218 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		9.24	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		9.23	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	FAM92A	A1XBS5	289 aa		9.23	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		9.23	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	LEFTY2	O00292	366 aa		9.23	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	CILP	O75339	1184 aa		9.23	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	FAM200B	P0CF97	657 aa		9.23	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	SKIL	P12757	684 aa		9.23	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	CXCL12	P48061	93 aa		9.23	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	NRL	P54845	237 aa		9.23	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	GSDMD	P57764	484 aa		9.23	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	ZXDB	P98169	803 aa		9.23	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	SATB1	Q01826	763 aa		9.23	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	9.23	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	CBLB	Q13191	982 aa		9.23	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	GAS6	Q14393	721 aa		9.23	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	ARID5B	Q14865	1188 aa		9.23	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	NCAPH	Q15003	741 aa		9.23	□□□□□ -0.93

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