RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478538.1

ITGB3BP-211, Transcript of integrin subunit beta 3 binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB3BP, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BP-211ENST00000478538 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 PGBD1Q96JS3 809 aa4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 PBKQ96KB5 322 aa4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 C8orf49Q96NF6 230 aa4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 MECRQ9BV79 373 aa4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 BRD8Q9H0E9 1235 aa4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZHX3Q9H4I2 956 aa4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 KLC4Q9NSK0 619 aa4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 KCTD5Q9NXV2 234 aa4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 KCND3Q9UK17 655 aa4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 FZD1Q9UP38 647 aa4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 DERAQ9Y315 318 aa4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 TOPBP1Q92547 1522 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 ARAP1Q96P48 1450 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 A6NLC8 198 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 PSMD9O00233 223 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 TJP3O95049 919 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 MBD4O95243 580 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 ONECUT2O95948 504 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 CYP21A2P08686 494 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 FAM163BP0C2L3 166 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 XBP1P17861 261 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 GKP32189 559 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 MCM5P33992 734 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 CHRNDQ07001 517 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 SLC12A1Q13621 1099 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 CDSNQ15517 529 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 TBCCQ15814 346 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 P3H1Q32P28 736 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 TIGD2Q4W5G0 525 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 TREML2Q5T2D2 321 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 SYT13Q7L8C5 426 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 MAATS1Q7Z4T9 603 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 GGNQ86UU5 652 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 HEATR4Q86WZ0 1026 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 PALM2Q8IXS6 379 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 USP38Q8NB14 1042 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 EXTL1Q92935 676 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 PRR25Q96S07 402 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 SLC26A6Q9BXS9 759 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 SERHL2Q9H4I8 314 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 TMLHEQ9NVH6 421 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 SMPD4Q9NXE4 827 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 TERF2IPQ9NYB0 399 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 EHD3Q9NZN3 535 aa4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 PRDM2Q13029 1718 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 VWC2LB2RUY7 222 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 M0QZQ0 153 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 PLSCR1O15162 318 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 PMPCBO75439 489 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 KRT38O76015 456 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 CD4P01730 458 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 ITGAMP11215 1152 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 ADRA1DP25100 572 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 PTGS2P35354 604 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 RXRGP48443 463 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 TPTEP56180 551 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 PTPRRQ15256 657 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 ANKRD1Q15327 319 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 TXNRD1Q16881 649 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 AAK1Q2M2I8 961 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 NBPF8Q3BBV2 869 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 TBRG1Q3YBR2 411 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 SPDYAQ5MJ70 313 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 HYIQ5T013 277 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 ABHD17BQ5VST6 288 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 KIAA0895LQ68EN5 471 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 RNF207Q6ZRF8 634 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 RASGRP2Q7LDG7 609 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 KRT27Q7Z3Y8 459 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 NPIPB3Q92617 1050 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 RFKQ969G6 155 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 FAR2Q96K12 515 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa4.56□□□□□ -1.68
ITGB3BP-211ENST00000478538 CCDC134Q9H6E4 229 aa4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms