RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
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SHQ1-207ENST00000475558 ZNF276Q8N554 614 aa7.34□□□□□ -1.23
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SHQ1-207ENST00000475558 ACTRT1Q8TDG2 376 aa7.34□□□□□ -1.23
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SHQ1-207ENST00000475558 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa7.33□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
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SHQ1-207ENST00000475558 RETREG1Q9H6L5 497 aa7.33□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 POPDC2Q9HBU9 364 aa7.33□□□□□ -1.24
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SHQ1-207ENST00000475558 IL37Q9NZH6 218 aa7.33□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 TRIM10Q9UDY6 481 aa7.33□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 HMGXB4Q9UGU5 601 aa7.33□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 ZMYM5Q9UJ78 669 aa7.33□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7.33□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM59LQ9UK28 342 aa7.33□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 MRFAP1Q9Y605 127 aa7.33□□□□□ -1.24
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