RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 STON1Q9Y6Q2 735 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 A0A1W2PQD8 194 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 GFRA2O00451 464 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 CILPO75339 1184 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 GABBR2O75899 941 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 PRKCHP24723 683 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 HOXD12P35452 270 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 GCLMP48507 274 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 GRIK2Q13002 908 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 KLHDC10Q6PID8 442 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 LRSAM1Q6UWE0 723 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 UNC93AQ86WB7 457 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 TMC2Q8TDI7 906 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 CYFIP2Q96F07 1278 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 TNIP3Q96KP6 325 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 ACACAQ13085 2346 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 ASXL3Q9C0F0 2248 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 A0A1B0GVL5 298 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 OPHN1O60890 802 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 F13A1P00488 732 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 HMBSP08397 361 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 SLFN14P0C7P3 912 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 FAM200BP0CF97 657 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 CD58P19256 250 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 DGKGP49619 791 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 AP3M2P53677 418 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 SCAPQ12770 1279 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 SLC36A4Q6YBV0 504 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 CEP76Q8TAP6 659 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 DNASE2BQ8WZ79 361 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 ARID3AQ99856 593 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 ORAI3Q9BRQ5 295 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 FBXO44Q9H4M3 255 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 SLC32A1Q9H598 525 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 MAGEF1Q9HAY2 307 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 ITM2CQ9NQX7 267 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 WDR35Q9P2L0 1181 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 RCOR1Q9UKL0 485 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 HPSEQ9Y251 543 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 ATP8B3O60423 1300 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 TMEM8BA6NDV4 472 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 PDXKO00764 312 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 RPN1P04843 607 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 FTH1P19P0C7X4 201 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 HLA-EP13747 358 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 PFKFB1P16118 471 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 PLA2G4AP47712 749 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 TPMTP51580 245 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 SGSHP51688 502 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 EFEMP1Q12805 493 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 ZNF234Q14588 700 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 PLEKHG6Q3KR16 790 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 ZCWPW2Q504Y3 356 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 ZNF394Q53GI3 561 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 KCNT1Q5JUK3 1230 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 C10orf120Q5SQS8 335 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 CEP135Q66GS9 1140 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 C19orf48Q6RUI8 117 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 CCDC186Q7Z3E2 898 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 PROSER1Q86XN7 944 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 CACUL1Q86Y37 369 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 HDDC3Q8N4P3 179 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 ZNF276Q8N554 614 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 SLC4A11Q8NBS3 891 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 TATDN2Q93075 761 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 MYEOVQ96EZ4 313 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 EEF2KMTQ96G04 330 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 GPR174Q9BXC1 333 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 DUSP16Q9BY84 665 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 NACA2Q9H009 215 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 RASAL2Q9UJF2 1139 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 DNMT3LQ9UJW3 386 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 NAGPAQ9UK23 515 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms