RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463378.5

RBBP4-208, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 5

Gene RBBP4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-208	ENST00000463378	CFI	P05156	583 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	MMP8	P22894	467 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	RAD52	P43351	418 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	ERV3-1	Q14264	604 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	MEA1	Q16626	185 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	NFIL3	Q16649	462 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	GEN1	Q17RS7	908 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	UBXN11	Q5T124	520 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM89A	Q96GI7	184 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	SERINC2	Q96SA4	455 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	VEZT	Q9HBM0	779 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378		A8MVJ9	347 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	WEE2	P0C1S8	567 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	ALOX12	P18054	663 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	GRK5	P34947	590 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	PNPLA4	P41247	253 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	RAP1GAP	P47736	663 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	CRHR2	Q13324	411 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	SEC23B	Q15437	767 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	AAK1	Q2M2I8	961 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	LINS1	Q8NG48	757 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	FUZ	Q9BT04	418 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	RMI1	Q9H9A7	625 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	PPM1D	O15297	605 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	TULP3	O75386	442 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	ELANE	P08246	267 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	PRKCH	P24723	683 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	ARL3	P36405	182 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	GPD2	P43304	727 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	CAMK1	Q14012	370 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	DCTN1	Q14203	1278 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	PKN1	Q16512	942 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	CYP2A13	Q16696	494 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	LY6K	Q17RY6	165 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	CFAP58	Q5T655	872 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	NGEF	Q8N5V2	710 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	CUL5	Q93034	780 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	BOD1	Q96IK1	185 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	VPS28	Q9UK41	221 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	GAGE12B	A1L429	117 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	ZAR1L	A6NP61	321 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378		B4DLN1	442 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	ORC4	O43929	436 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBBP4-208	ENST00000463378	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36

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