RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-208ENST00000462335 DHCR24Q15392 516 aa9.99□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 EML3Q32P44 896 aa9.99□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 TPGS1Q6ZTW0 290 aa9.99□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 HTR3DQ70Z44 454 aa9.99□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 BBS7Q8IWZ6 715 aa9.99□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa9.99□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 EPS8L1Q8TE68 723 aa9.99□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 CLEC4CQ8WTT0 213 aa9.99□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 DDI1Q8WTU0 396 aa9.99□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 CD101Q93033 1021 aa9.99□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 SERPINB11Q96P15 392 aa9.99□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 CPXM1Q96SM3 734 aa9.99□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 BBS2Q9BXC9 721 aa9.99□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 OSBPL6Q9BZF3 934 aa9.99□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 LTB4R2Q9NPC1 389 aa9.99□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 SPHK2Q9NRA0 654 aa9.99□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 TMEM51Q9NW97 253 aa9.99□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 ADAM22Q9P0K1 906 aa9.99□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 DEC1Q9P2X7 70 aa9.99□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 STAP1Q9ULZ2 295 aa9.99□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 TBC1D3BA6NDS4 549 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 LRRC53A6NM62 1247 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 EPHB6O15197 1021 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 LAMTOR5O43504 91 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 ATG13O75143 517 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 STC2O76061 302 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 CALB1P05937 261 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 ABCB4P21439 1286 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 GJA4P35212 333 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 NUBP1P53384 320 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 NME3Q13232 169 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 MTA1Q13330 715 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 TRIM14Q14142 442 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 E2F5Q15329 346 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 LY6G5CQ5SRR4 150 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 SDE2Q6IQ49 451 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 DRC7Q8IY82 874 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 NAT16Q8N8M0 369 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 DTWD2Q8NBA8 298 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 SLC20A1Q8WUM9 679 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 BHMTQ93088 406 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 PNKPQ96T60 521 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 SELENOOQ9BVL4 669 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 DEF6Q9H4E7 631 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 HPS4Q9NQG7 708 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 ASNSD1Q9NWL6 643 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 DDIT4Q9NX09 232 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 RRN3Q9NYV6 651 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 TJP2Q9UDY2 1190 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 PATJQ8NI35 1801 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 TECTAO75443 2155 aa9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 TMCO5BA8MYB1 307 aa9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 MSI1O43347 362 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 F9P00740 461 aa9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 ERBB2P04626 1255 aa9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 COL9A1P20849 921 aa9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 TARSP26639 723 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 NOS2P35228 1153 aa9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 GALK1P51570 392 aa9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 ZBED6P86452 979 aa9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 FBXO43Q4G163 708 aa9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 FIGNQ5HY92 759 aa9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 ADGRF1Q5T601 910 aa9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 DCUN1D2Q6PH85 259 aa9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 RHBDF2Q6PJF5 856 aa9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 BEND5Q7L4P6 421 aa9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 DEFB106AQ8N104 65 aa9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 SYNPOQ8N3V7 929 aa9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 WDTC1Q8N5D0 677 aa9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 SLC30A5Q8TAD4 765 aa9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 ADAM32Q8TC27 787 aa9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 C11orf70Q9BRQ4 267 aa9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 C11orf16Q9NQ32 467 aa9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 ARHGEF4Q9NR80 690 aa9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.813e-12■■■■□ 19.8
PKP4-208ENST00000462335 CYTH4Q9UIA0 394 aa9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 TLR6Q9Y2C9 796 aa9.97□□□□□ -0.81
PKP4-208ENST00000462335 HELZP42694 1942 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms