RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436996.1

TTC28-AS1-215, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WNT16Q9UBV4 365 aa9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DNMT3LQ9UJW3 386 aa9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SDK1Q7Z5N4 2213 aa9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NUP205Q92621 2012 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SHROOM3Q8TF72 1996 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SOBPA7XYQ1 873 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMCO5BA8MYB1 307 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP9.83□□□□□ -0.844e-10■■□□□ 14.2
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IRAK2O43187 625 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FBXO21O94952 628 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IGLV3-25P01717 112 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IGLV3-27P01718 113 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 UNGP13051 313 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NCAM1P13591 858 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PFKLP17858 780 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FLT3P36888 993 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ACADSBP45954 432 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC6A11P48066 632 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 STARD6P59095 220 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PLCB2Q00722 1185 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PFKPQ01813 784 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CENPCQ03188 943 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FZD5Q13467 585 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DHCR24Q15392 516 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HGSNATQ68CP4 663 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NADSYN1Q6IA69 706 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FSTL4Q6MZW2 842 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KLHDC10Q6PID8 442 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MON1BQ7L1V2 547 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMEM25Q86YD3 366 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 VSTM4Q8IW00 320 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DEFB106AQ8N104 65 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ARHGAP18Q8N392 663 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EMC1Q8N766 993 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMEM35BQ8NCS4 154 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PRSS33Q8NF86 280 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 STK32AQ8WU08 396 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 E2F7Q96AV8 911 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC2A13Q96QE2 648 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AGPAT1Q99943 283 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HAUS4Q9H6D7 363 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ANLNQ9NQW6 1124 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PLK2Q9NYY3 685 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZMYM5Q9UJ78 669 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CLEC4EQ9ULY5 219 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SNX10Q9Y5X0 201 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NUMA1Q14980 2115 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ITIH6Q6UXX5 1313 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KANSL1LA0AUZ9 987 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 E2F8A0AVK6 867 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 I6L893 689 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 STK25O00506 426 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LSM8O95777 96 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EGFP01133 1207 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ADH5P11766 374 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FERP16591 822 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AOC1P19801 751 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC6A4P31645 630 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CASP14P31944 242 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PSEN1P49768 467 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IRAK1P51617 712 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BPIFB4P59827 614 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PRKCQQ04759 706 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GAS6Q14393 721 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PDGFRLQ15198 375 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SFMBT2Q5VUG0 894 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RFWD3Q6PCD5 774 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RHBDF2Q6PJF5 856 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TPGS1Q6ZTW0 290 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC26A9Q7LBE3 791 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMC6Q7Z403 805 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DENND1CQ8IV53 801 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PHTF2Q8N3S3 785 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CPA6Q8N4T0 437 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WFDC5Q8TCV5 224 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RNF139Q8WU17 664 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM3CQ92520 227 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ATP2A3Q93084 1043 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SYNCQ9H7C4 482 aa9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms