RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431558.1

PRRT3-AS1-201, PRRT3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRRT3-AS1, Length 614 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LRP3O75074 770 aa17.08■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SETSIPP0DME0 302 aa17.08■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DAOAP59103 153 aa17.08■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CCDC6Q16204 474 aa17.08■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CSRP2Q16527 193 aa17.08■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 BSPRYQ5W0U4 402 aa17.08■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 GRAMD4Q6IC98 578 aa17.08■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DENND1CQ8IV53 801 aa17.08■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CRACR2AQ9BSW2 395 aa17.08■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CLSTN2Q9H4D0 955 aa17.08■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa17.08■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FBXO10Q9UK96 956 aa17.08■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CNTN6Q9UQ52 1028 aa17.08■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZNF510Q9Y2H8 683 aa17.08■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 STARD13Q9Y3M8 1113 aa17.08■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 M0QYV0 167 aa17.07■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 EPN2O95208 641 aa17.07■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SLC9A1P19634 815 aa17.07■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 WASP42768 502 aa17.07■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 APBA1Q02410 837 aa17.07■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LMNB2Q03252 620 aa17.07■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP17.07■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 EOGTQ5NDL2 527 aa17.07■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FYB2Q5VWT5 728 aa17.07■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa17.07■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 GJB7Q6PEY0 223 aa17.07■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FMNL3Q8IVF7 1028 aa17.07■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa17.07■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SCML4Q8N228 414 aa17.07■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CLEC4CQ8WTT0 213 aa17.07■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LOXL4Q96JB6 756 aa17.07■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ACOX2Q99424 681 aa17.07■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DCLK3Q9C098 648 aa17.07■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CNGB3Q9NQW8 809 aa17.07■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 STRIP2Q9ULQ0 834 aa17.07■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 THADAQ6YHU6 1953 aa17.06■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa17.06■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 GDF9O60383 454 aa17.06■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PENKP01210 267 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 BCKDHBP21953 392 aa17.06■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DGKGP49619 791 aa17.06■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ARHGAP8P85298 464 aa17.06■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PRR23CQ6ZRP0 262 aa17.06■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FRMD1Q8N878 549 aa17.06■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MLKLQ8NB16 471 aa17.06■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 OLIG1Q8TAK6 271 aa17.06■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KCNV2Q8TDN2 545 aa17.06■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SMOC1Q9H4F8 434 aa17.06■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ACP6Q9NPH0 428 aa17.06■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CLEC4EQ9ULY5 219 aa17.06■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CHKAP35790 457 aa17.05■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 GPD2P43304 727 aa17.05■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 STILQ15468 1287 aa17.05■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DENND1BQ6P3S1 775 aa17.05■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TRIM65Q6PJ69 517 aa17.05■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ERMP1Q7Z2K6 904 aa17.05■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa17.05■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RNF139Q8WU17 664 aa17.05■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RLN3Q8WXF3 142 aa17.05■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PLD4Q96BZ4 506 aa17.05■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HSFY1Q96LI6 401 aa17.05■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ABCC13Q9NSE7 274 aa17.05■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 A0A1W2PQF6 199 aa17.04■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa17.04■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MSI1O43347 362 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ALDH1A2O94788 518 aa17.04■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KRT5P13647 590 aa17.04■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NTSR1P30989 418 aa17.04■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 GBP1P32455 592 aa17.04■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RPL34P49207 117 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DPCR1Q3MIW9 517 aa17.04■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PLA2G2CQ5R387 149 aa17.04■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NUDT18Q6ZVK8 323 aa17.04■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FAM217AQ8IXS0 508 aa17.04■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CPXM2Q8N436 756 aa17.04■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HMGB4Q8WW32 186 aa17.04■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 IRGQQ8WZA9 623 aa17.04■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ERLEC1Q96DZ1 483 aa17.04■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MIS12Q9H081 205 aa17.04■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CD248Q9HCU0 757 aa17.04■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RXFP3Q9NSD7 469 aa17.04■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LMBRD1Q9NUN5 540 aa17.04■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NUP205Q92621 2012 aa17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms