RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		18.63	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	MORC3	Q14149	939 aa		18.63	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	ANO4	Q32M45	955 aa		18.63	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	EMC10	Q5UCC4	262 aa		18.63	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	ALLC	Q8N6M5	410 aa		18.63	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	NAT16	Q8N8M0	369 aa		18.63	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	18.63	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		18.63	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	18.63	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		18.63	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		18.62	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	SGK1	O00141	431 aa		18.62	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	CACNG3	O60359	315 aa		18.62	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	STC2	O76061	302 aa		18.62	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	18.62	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	LMAN2	Q12907	356 aa		18.62	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	18.62	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		18.62	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		18.62	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		18.62	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		18.62	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	TERB1	Q8NA31	727 aa		18.62	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	DEFB124	Q8NES8	71 aa		18.62	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	LMO3	Q8TAP4	145 aa		18.62	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		18.62	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	GATA6	Q92908	595 aa		18.62	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	DEC1	Q9P2X7	70 aa		18.62	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	HCN2	Q9UL51	889 aa		18.62	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	18.62	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		18.62	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	AKAP13	Q12802	2813 aa		18.62	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	18.61	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM24	O15164	1050 aa		18.61	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	MAP3K13	O43283	966 aa		18.61	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	ADAM23	O75077	832 aa		18.61	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	18.61	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	RALA	P11233	206 aa		18.61	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	P2RY2	P41231	377 aa		18.61	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	BCAT1	P54687	386 aa		18.61	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	18.61	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	SGO2	Q562F6	1265 aa		18.61	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		18.61	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		18.61	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		18.61	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		18.61	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	NELFB	Q8WX92	580 aa		18.61	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	18.61	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	BICDL2	A1A5D9	508 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	TULP2	O00295	520 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738		O00370	1275 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	P4HA2	O15460	535 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	KLKB1	P03952	638 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	VDR	P11473	427 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	TYR	P14679	529 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	TKTL1	P51854	596 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC8A3	P57103	927 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	PDE4C	Q08493	712 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	LRMP	Q12912	555 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	PKDCC	Q504Y2	493 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	EOGT	Q5NDL2	527 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	MIB1	Q86YT6	1006 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	SYT12	Q8IV01	421 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	RLN3	Q8WXF3	142 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	P2RY11	Q96G91	374 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	BBS2	Q9BXC9	721 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC32A1	Q9H598	525 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	SPEG	Q15772	3267 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		18.59	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	ZBED1	O96006	694 aa		18.59	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	PAEP	P09466	180 aa		18.59	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	18.59	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	COG7	P83436	770 aa		18.59	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		18.59	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		18.59	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		18.59	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	SPACA7	Q96KW9	195 aa		18.59	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	NT5C1B	Q96P26	610 aa		18.59	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		18.59	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		18.59	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		18.59	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	FBXO10	Q9UK96	956 aa		18.59	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		18.59	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		18.59	■□□□□ 0.57
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		18.59	■□□□□ 0.57

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms