RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP18.98■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 WDR90Q96KV7 1748 aa18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 SPAG6O75602 509 aa18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 TOM1L1O75674 476 aa18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 MAP3K6O95382 1288 aa18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 C9orf131Q5VYM1 1079 aa18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 C1orf228Q6PIY5 440 aa18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 SULF1Q8IWU6 871 aa18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRN4Q8WUT4 740 aa18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 CLMNQ96JQ2 1002 aa18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 KLHL4Q9C0H6 718 aa18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 C20orf27Q9GZN8 174 aa18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 PLAC1Q9HBJ0 212 aa18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 PNPLA8Q9NP80 782 aa18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 LMCD1Q9NZU5 365 aa18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 ARHGAP42A6NI28 874 aa18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 H7C0C1 242 aa18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 HOXC6P09630 235 aa18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 AOC1P19801 751 aa18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP5OP48047 213 aa18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 CDH6P55285 790 aa18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC25A3Q00325 362 aa18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 NOMO1Q15155 1222 aa18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 ZPBP2Q6X784 338 aa18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 EBF4Q9BQW3 602 aa18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 ACAD9Q9H845 621 aa18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 RSAD1Q9HA92 442 aa18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 SMYD2Q9NRG4 433 aa18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 HOXC10Q9NYD6 342 aa18.97■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 SDR42E2A6NKP2 422 aa18.96■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 SNNO75324 88 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT37O76014 449 aa18.96■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 VAV1P15498 845 aa18.96■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 CCNFP41002 786 aa18.96■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 AQP4P55087 323 aa18.96■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 SH3D19Q5HYK7 790 aa18.96■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 SPATA24Q86W54 205 aa18.96■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 LHX5Q9H2C1 402 aa18.96■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 ELP3Q9H9T3 547 aa18.96■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 HMGXB4Q9UGU5 601 aa18.96■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 TMCO1Q9UM00 188 aa18.96■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 PIK3R2O00459 728 aa18.96■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 RFPL1O75677 317 aa18.96■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT19P08727 400 aa18.96■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 VCLP18206 1134 aa18.96■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 WASHC5Q12768 1159 aa18.96■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 SATL1Q86VE3 508 aa18.96■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 TWNKQ96RR1 684 aa18.96■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa18.96■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 SMYD3Q9H7B4 428 aa18.96■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 OGTO15294 1046 aa18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 CHADO15335 359 aa18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNN4O15554 427 aa18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 XIAPP98170 497 aa18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 CNTN2Q02246 1040 aa18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 DLG1Q12959 904 aa18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 GRM1Q13255 1194 aa18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 CCNIQ14094 377 aa18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 LCA5Q86VQ0 697 aa18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 GDPD5Q8WTR4 605 aa18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 POPDC2Q9HBU9 364 aa18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 BTBD7Q9P203 1132 aa18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF180Q9UJW8 692 aa18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 PTPRFP10586 1907 aa18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 OTOFQ9HC10 1997 aa18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 APRTP07741 180 aa18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 CDO1Q16878 200 aa18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC26A7Q8TE54 656 aa18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 OTUD5Q96G74 571 aa18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 PCYT2Q99447 389 aa18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 USP29Q9HBJ7 922 aa18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 ETNK2Q9NVF9 386 aa18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 MKS1Q9NXB0 559 aa18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 SORCS3Q9UPU3 1222 aa18.95■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 BPGMP07738 259 aa18.94■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 PEX2P28328 305 aa18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms