RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417497.5

TTC28-AS1-202, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TTC28-AS1, Length 627 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PNKPQ96T60 521 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ARHGEF4Q9NR80 690 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZSCAN32Q9NX65 697 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PLK2Q9NYY3 685 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SIK3Q9Y2K2 1263 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 LGALS16A8MUM7 142 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PROB1E7EW31 1015 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 F8VZ95 297 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TULP3O75386 442 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 KAT7O95251 611 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 FYNP06241 537 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NCAM1P13591 858 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TYRP14679 529 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PXNP49023 591 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 FNTBP49356 437 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 UBXN1Q04323 297 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PPP2R5DQ14738 602 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 FBXO43Q4G163 708 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 EMC10Q5UCC4 262 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TAF3Q5VWG9 929 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MSANTD2Q6P1R3 559 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TMEM110Q86TL2 294 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PHTF2Q8N3S3 785 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ATRIPQ8WXE1 791 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NELL1Q92832 810 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PLD4Q96BZ4 506 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 FUCA2Q9BTY2 467 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 STK33Q9BYT3 514 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 DCLK3Q9C098 648 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NLRC4Q9NPP4 1024 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PCDHGC3Q9UN70 934 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MYO15AQ9UKN7 3530 aa13.87□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PRR23AA6NEV1 266 aa13.87□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GFRA3O60609 400 aa13.87□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GFPT2O94808 682 aa13.87□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ERBB2P04626 1255 aa13.87□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 APODP05090 189 aa13.87□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CYP11B1P15538 503 aa13.87□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GRIA2P42262 883 aa13.87□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZNF165P49910 485 aa13.87□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TAF5Q15542 800 aa13.87□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SYPL2Q5VXT5 272 aa13.87□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CCDC33Q8N5R6 958 aa13.87□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZBTB44Q8NCP5 570 aa13.87□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ADAM32Q8TC27 787 aa13.87□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 USP33Q8TEY7 942 aa13.87□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa13.87□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 HHIPQ96QV1 700 aa13.87□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 LHX5Q9H2C1 402 aa13.87□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 WDR35Q9P2L0 1181 aa13.87□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 DEC1Q9P2X7 70 aa13.87□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZNF510Q9Y2H8 683 aa13.87□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa13.87□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TBC1D3BA6NDS4 549 aa13.86□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 LRRC10BA6NIK2 292 aa13.86□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SART1O43290 800 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CACNG3O60359 315 aa13.86□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TSPAN3O60637 253 aa13.86□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ATG13O75143 517 aa13.86□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GRAP2O75791 330 aa13.86□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TIE1P35590 1138 aa13.86□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 HARS2P49590 506 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 BPIFB4P59827 614 aa13.86□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PTPN20Q4JDL3 420 aa13.86□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 C10orf76Q5T2E6 689 aa13.86□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GRAMD4Q6IC98 578 aa13.86□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa13.86□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ALLCQ8N6M5 410 aa13.86□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SLC20A1Q8WUM9 679 aa13.86□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 BPIFA3Q9BQP9 254 aa13.86□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PDCL3Q9H2J4 239 aa13.86□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MARK1Q9P0L2 795 aa13.86□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SLC8A2Q9UPR5 921 aa13.86□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CAPN9O14815 690 aa13.85□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PENKP01210 267 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 IGLV3-27P01718 113 aa13.85□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MMEP08473 750 aa13.85□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms