RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407117.6

ANKRD54-203, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-203ENST00000407117 BHLHA9Q7RTU4 235 aa29.09■■■□□ 2.25
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ANKRD54-203ENST00000407117 VPS45Q9NRW7 570 aa29.09■■■□□ 2.25
ANKRD54-203ENST00000407117 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP29.09■■■□□ 2.25
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ANKRD54-203ENST00000407117 TRIM24O15164 1050 aa29.08■■■□□ 2.25
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ANKRD54-203ENST00000407117 NTSR1P30989 418 aa29.08■■■□□ 2.25
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ANKRD54-203ENST00000407117 PMS2CLQ68D20 193 aa29.08■■■□□ 2.25
ANKRD54-203ENST00000407117 EHBP1Q8NDI1 1231 aa29.08■■■□□ 2.25
ANKRD54-203ENST00000407117 UBA3Q8TBC4 463 aa29.08■■■□□ 2.25
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ANKRD54-203ENST00000407117 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa29.08■■■□□ 2.25
ANKRD54-203ENST00000407117 CNGB3Q9NQW8 809 aa29.08■■■□□ 2.25
ANKRD54-203ENST00000407117 KIAA1468Q9P260 1216 aa29.08■■■□□ 2.25
ANKRD54-203ENST00000407117 FBXO10Q9UK96 956 aa29.08■■■□□ 2.25
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ANKRD54-203ENST00000407117 SPACA7Q96KW9 195 aa29.07■■■□□ 2.24
ANKRD54-203ENST00000407117 CHMP5Q9NZZ3 219 aa29.07■■■□□ 2.24
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ANKRD54-203ENST00000407117 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP29.07■■■□□ 2.24
ANKRD54-203ENST00000407117 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa29.06■■■□□ 2.24
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ANKRD54-203ENST00000407117 P2RY2P41231 377 aa29.06■■■□□ 2.24
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ANKRD54-203ENST00000407117 RNF139Q8WU17 664 aa29.06■■■□□ 2.24
ANKRD54-203ENST00000407117 SLC35F5Q8WV83 523 aa29.06■■■□□ 2.24
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ANKRD54-203ENST00000407117 ABCC13Q9NSE7 274 aa29.06■■■□□ 2.24
ANKRD54-203ENST00000407117 HCN2Q9UL51 889 aa29.06■■■□□ 2.24
ANKRD54-203ENST00000407117 INVSQ9Y283 1065 aa29.06■■■□□ 2.24
ANKRD54-203ENST00000407117 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa29.06■■■□□ 2.24
ANKRD54-203ENST00000407117 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
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ANKRD54-203ENST00000407117 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa29.05■■■□□ 2.24
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ANKRD54-203ENST00000407117 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa29.05■■■□□ 2.24
ANKRD54-203ENST00000407117 DENND1CQ8IV53 801 aa29.05■■■□□ 2.24
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ANKRD54-203ENST00000407117 YJEFN3A6XGL0 299 aa29.04■■■□□ 2.24
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ANKRD54-203ENST00000407117 E7ENQ6 273 aa29.04■■■□□ 2.24
ANKRD54-203ENST00000407117 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
ANKRD54-203ENST00000407117 CYBBP04839 570 aa29.04■■■□□ 2.24
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF132P52740 706 aa29.04■■■□□ 2.24
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ANKRD54-203ENST00000407117 CREB5Q02930 508 aa29.04■■■□□ 2.24
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ANKRD54-203ENST00000407117 ARHGEF19Q8IW93 802 aa29.04■■■□□ 2.24
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ANKRD54-203ENST00000407117 CHPFQ8IZ52 775 aa29.04■■■□□ 2.24
ANKRD54-203ENST00000407117 IRGQQ8WZA9 623 aa29.04■■■□□ 2.24
ANKRD54-203ENST00000407117 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
ANKRD54-203ENST00000407117 PLK2Q9NYY3 685 aa29.04■■■□□ 2.24
ANKRD54-203ENST00000407117 DCDC2BA2VCK2 349 aa29.03■■■□□ 2.24
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ANKRD54-203ENST00000407117 GFRA2O00451 464 aa29.03■■■□□ 2.24
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ANKRD54-203ENST00000407117 FMNL3Q8IVF7 1028 aa29.03■■■□□ 2.24
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ANKRD54-203ENST00000407117 ZSWIM1Q9BR11 485 aa29.03■■■□□ 2.24
ANKRD54-203ENST00000407117 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
ANKRD54-203ENST00000407117 CNTN6Q9UQ52 1028 aa29.03■■■□□ 2.24
ANKRD54-203ENST00000407117 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
ANKRD54-203ENST00000407117 LCP1P13796 627 aa29.02■■■□□ 2.24
ANKRD54-203ENST00000407117 BRD2P25440 801 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF445P59923 1031 aa29.02■■■□□ 2.24
ANKRD54-203ENST00000407117 CAMK4Q16566 473 aa29.02■■■□□ 2.24
ANKRD54-203ENST00000407117 PMF1Q6P1K2 205 aa29.02■■■□□ 2.24
ANKRD54-203ENST00000407117 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
ANKRD54-203ENST00000407117 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.24
ANKRD54-203ENST00000407117 A0A1W2PQF6 199 aa29.01■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 NPC1O15118 1278 aa29.01■■■□□ 2.23
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ANKRD54-203ENST00000407117 E2F5Q15329 346 aa29.01■■■□□ 2.23
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