RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 RBL1P28749 1068 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 TTLL9Q3SXZ7 439 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 GPC2Q8N158 579 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 VPS28Q9UK41 221 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 WDR27A2RRH5 827 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 IRF6O14896 467 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 USP12O75317 370 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 RECQL4O94761 1208 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 HMGCRP04035 888 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 GRK2P25098 689 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 MGAT1P26572 445 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC6A3Q01959 620 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 MARC1Q5VT66 337 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 CARNMT1Q8N4J0 409 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 PLSCR1O15162 318 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 NCAM2O15394 837 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC130P13994 396 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF280DQ6N043 979 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 IRF2BP1Q8IU81 584 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 HES2Q9Y543 173 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 ATP6V1B1P15313 513 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 CNTFP26441 200 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 TM4SF1P30408 202 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 MFSD10Q14728 455 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 SCUBE1Q8IWY4 988 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM71AQ8IYT1 594 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 TNFRSF25Q93038 417 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 KCND1Q9NSA2 647 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 EVPLLA8MZ36 301 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 H7C4K7 107 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 C4orf32Q8N8J7 132 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 TEKT2Q9UIF3 430 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 RNF103O00237 685 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 ACVR2BQ13705 512 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 LRP10Q7Z4F1 713 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 SPATA20Q8TB22 786 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 DDI1Q8WTU0 396 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC126Q96EE4 140 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 STARD7Q9NQZ5 370 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 SPASTQ9UBP0 616 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 NUDT5Q9UKK9 219 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 TGFB1I1O43294 461 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNA4P22459 653 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 GALNTL6Q49A17 601 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF333Q96JL9 665 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 GAD1Q99259 594 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 SUFUQ9UMX1 484 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 TSPAN3O60637 253 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 APOC2P02655 101 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 ALDH2P05091 517 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 RHOCP08134 193 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 FGRP09769 529 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 MYBL2P10244 700 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 ETS1P14921 441 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 FAAP100Q0VG06 881 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 MAMLD1Q13495 774 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 ARSHQ5FYA8 562 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 KATNAL2Q8IYT4 538 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 PGBD3Q8N328 593 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 GOLGA8TH3BQL2 631 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 KRT16P08779 473 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 CALB2P22676 271 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 BEX3Q00994 111 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 UGT3A1Q6NUS8 523 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 FOXR1Q6PIV2 292 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 SHC3Q92529 594 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 PPP2R3CQ969Q6 453 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 MAP2K7O14733 419 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 DNAJB2P25686 324 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 GP5P40197 560 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 TAF2Q6P1X5 1199 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 OR5B17Q8NGF7 314 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 PGM2Q96G03 612 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIM16O95361 564 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 KDELR1P24390 212 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 VPS37AQ8NEZ2 397 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 PHF21BQ96EK2 531 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 CAAP1Q9H8G2 361 aa17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms