RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 ZBED1O96006 694 aa13.66□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 AMPD1P23109 780 aa13.66□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 RBL1P28749 1068 aa13.66□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 GSTA3Q16772 222 aa13.66□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 ILDR2Q71H61 639 aa13.66□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 CXorf38Q8TB03 319 aa13.66□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 NT5C1AQ9BXI3 368 aa13.66□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 ASB7Q9H672 318 aa13.66□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 USP29Q9HBJ7 922 aa13.66□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 TXNRD2Q9NNW7 524 aa13.66□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 GALNT8Q9NY28 637 aa13.66□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 ERAP1Q9NZ08 941 aa13.66□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 LTBP3Q9NS15 1303 aa13.66□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 KAT6AQ92794 2004 aa13.66□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 TRIM49D1C9J1S8 452 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 COPEO14579 308 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 COQ9O75208 318 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 SPAG6O75602 509 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 HAUS5O94927 633 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 VTNP04004 478 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 APRTP07741 180 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 RBP5P82980 135 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC14Q49A88 953 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 LIN52Q52LA3 116 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 SMYD5Q6GMV2 418 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC62Q6P9F0 684 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 LCLAT1Q6UWP7 414 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 IZUMO2Q6UXV1 221 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 SLC26A11Q86WA9 606 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 VPS52Q8N1B4 723 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 ARHGAP18Q8N392 663 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 MIS12Q9H081 205 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 DPP3Q9NY33 737 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF212Q9UDV6 495 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 TTC36A6NLP5 189 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 CCNFP41002 786 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 INHBCP55103 352 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 TTLL4Q14679 1199 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 BOLA3Q53S33 107 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 LCA5Q86VQ0 697 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 FAM172AQ8WUF8 416 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 KLC2Q9H0B6 622 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-202ENST00000375175 OSBPP22059 807 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 SLC18A2Q05940 514 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 LSAMPQ13449 338 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 PDK2Q15119 407 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 SCUBE3Q8IX30 993 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 ACAP3Q96P50 834 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 HAPLN3Q96S86 360 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 VRTNQ9H8Y1 702 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 KRT37O76014 449 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 FAM163BP0C2L3 166 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 IL4RP24394 825 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 SERPINB3P29508 390 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 SDC4P31431 198 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 ETV4P43268 484 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 AMHR2Q16671 573 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 CA9Q16790 459 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF484Q5JVG2 852 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 PMF1Q6P1K2 205 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 CHSY1Q86X52 802 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC110Q8TBZ0 833 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 NLRP7Q8WX94 980 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 KIF12Q96FN5 646 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 NSL1Q96IY1 281 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 NFKBIZQ9BYH8 718 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 SLC13A1Q9BZW2 595 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 PCDH18Q9HCL0 1135 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 FAM49BQ9NUQ9 324 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 ETNK2Q9NVF9 386 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 RBPJLQ9UBG7 517 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 ITGA11Q9UKX5 1188 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 KIAA1257Q9ULG3 409 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa13.64□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 C2orf71A6NGG8 1288 aa13.63□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 ADM5C9JUS6 153 aa13.63□□□□□ -0.23
TMOD1-202ENST00000375175 PENKP01210 267 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms