RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
OPN3-201ENST00000366554 ACO1P21399 889 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.19
OPN3-201ENST00000366554 NRLP54845 237 aa22.45■■□□□ 1.19
OPN3-201ENST00000366554 NFIXQ14938 502 aa22.45■■□□□ 1.19
OPN3-201ENST00000366554 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa22.45■■□□□ 1.19
OPN3-201ENST00000366554 BBS12Q6ZW61 710 aa22.45■■□□□ 1.19
OPN3-201ENST00000366554 CFAP36Q96G28 342 aa22.45■■□□□ 1.19
OPN3-201ENST00000366554 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.19
OPN3-201ENST00000366554 SOBPA7XYQ1 873 aa22.45■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 FUCA1P04066 466 aa22.45■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 MMP8P22894 467 aa22.45■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 SLC5A3P53794 718 aa22.45■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 TUBA4AP68366 448 aa22.45■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 EPS15L1Q9UBC2 864 aa22.45■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 H3BNH8 94 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 DCXO43602 365 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 KRT38O76015 456 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 SERPINB2P05120 415 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 OCM2P0CE71 109 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 STAT2P52630 851 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 CYP24A1Q07973 514 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 FLOT2Q14254 428 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 KCNJ11Q14654 390 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 BORCS5Q969J3 196 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 MCEEQ96PE7 176 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 FAM96AQ9H5X1 160 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 VPS45Q9NRW7 570 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 PNPOQ9NVS9 261 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 GSTT2P0CG29 244 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 GSTT2BP0CG30 244 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 SLURP2P0DP57 97 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 GPR180Q86V85 440 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 SORT1Q99523 831 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 EBF1Q9UH73 591 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 CDH7Q9ULB5 785 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 C7orf72A4D263 438 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 ZBTB14O43829 449 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 GNA15P30679 374 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 AGAP3Q96P47 875 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 GPRC5CQ9NQ84 441 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 TRIM17Q9Y577 477 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 KAT6AQ92794 2004 aa22.44■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 HMOX2P30519 316 aa22.43■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 THOP1P52888 689 aa22.43■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 CTBSQ01459 385 aa22.43■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 OLFML1Q6UWY5 402 aa22.43■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 CARM1Q86X55 608 aa22.43■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 ISOC1Q96CN7 298 aa22.43■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 SGF29Q96ES7 293 aa22.43■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 SNX27Q96L92 541 aa22.43■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 SERPINI1Q99574 410 aa22.43■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.43■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 OLAHQ9NV23 265 aa22.43■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 CSH1P0DML2 217 aa22.43■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 CSH2P0DML3 217 aa22.43■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 ARP10275 920 aa22.43■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 IL1R1P14778 569 aa22.43■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 GABRB2P47870 512 aa22.43■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 PEX3P56589 373 aa22.43■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 KLF10Q13118 480 aa22.43■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa22.43■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.43■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 POLNQ7Z5Q5 900 aa22.43■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 USP37Q86T82 979 aa22.43■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 HOMEZQ8IX15 550 aa22.43■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 UBR7Q8N806 425 aa22.43■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 C8BP07358 591 aa22.42■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 RARRES1P49788 294 aa22.42■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 CEP55Q53EZ4 464 aa22.42■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 MROH9Q5TGP6 573 aa22.42■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 CENPSQ8N2Z9 138 aa22.42■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 PLEKHA8Q96JA3 519 aa22.42■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 POPDC2Q9HBU9 364 aa22.42■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 MYRFQ9Y2G1 1151 aa22.42■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 H0YJX3 145 aa22.42■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms