RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 YY2O15391 372 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 PMPCBO75439 489 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 MBPP02686 304 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 CREB1P16220 341 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF20P17024 532 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 LAG3P18627 525 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 BMPR1AP36894 532 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 PDE1AP54750 535 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 ADAM17P78536 824 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 GALNT2Q10471 571 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 GAB1Q13480 694 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 CSHL1Q14406 222 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 AAK1Q2M2I8 961 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 FNDC7Q5VTL7 733 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 RNF207Q6ZRF8 634 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 DTX2Q86UW9 622 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 KRT73Q86Y46 540 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 VRK3Q8IV63 474 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 NAXEQ8NCW5 288 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR6Y1Q8NGX8 325 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 KCNG4Q8TDN1 519 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZUFSPQ96AP4 578 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 SKA1Q96BD8 255 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 HVCN1Q96D96 273 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 AIFM2Q9BRQ8 373 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 GPR63Q9BZJ6 419 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 CLPBQ9H078 707 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 SMPD4Q9NXE4 827 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 TERF2IPQ9NYB0 399 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 STEAP1Q9UHE8 339 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 GXYLT2A0PJZ3 443 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 GAGE12BA1L429 117 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 WDR27A2RRH5 827 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 VWA3AA6NCI4 1184 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 GAGE12HA6NDE8 117 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 LINC00473A8K010 186 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 H0YIZ8 118 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 IFNL4K9M1U5 179 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 MGST3O14880 152 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 SUV39H1O43463 412 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 EBLN1P0CF75 366 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 ACP5P13686 325 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 BDNFP23560 247 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 GKP32189 559 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 CYP2C18P33260 490 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 GALNSP34059 522 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 DIO1P49895 249 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 TAS2R50P59544 299 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 RPL15P61313 204 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 UBE3AQ05086 875 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 FSTL1Q12841 308 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 ATG16L1Q676U5 607 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 KIRREL2Q6UWL6 708 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 NAPRTQ6XQN6 538 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 Q6ZWC4 215 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPRED1Q7Z699 444 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 MRGPREQ86SM8 312 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM57Q8N5G2 664 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM71DQ8N9W8 422 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 PROKR1Q8TCW9 393 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 ST8SIA4Q92187 359 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 MYEOVQ96EZ4 313 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 REEP2Q9BRK0 252 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 ELOVL1Q9BW60 279 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 USP44Q9H0E7 712 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZHX3Q9H4I2 956 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 SERHL2Q9H4I8 314 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 USP29Q9HBJ7 922 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 WASH6PQ9NQA3 447 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 FBXO28Q9NVF7 368 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 TBCCD1Q9NVR7 557 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 DLL3Q9NYJ7 618 aa2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms