RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 ZSWIM1Q9BR11 485 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 BBS2Q9BXC9 721 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 THAP9Q9H5L6 903 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 MARCH2Q9P0N8 246 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 WDR35Q9P2L0 1181 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 DEC1Q9P2X7 70 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 STRIP2Q9ULQ0 834 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 CEP295Q9C0D2 2601 aa8.02□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 FRYQ5TBA9 3013 aa8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 TBC1D3BA6NDS4 549 aa8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 YJEFN3A6XGL0 299 aa8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 E7ENQ6 273 aa8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 AXIN1O15169 862 aa8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 CALCAP01258 141 aa8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 RETP07949 1114 aa8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 HMBSP08397 361 aa8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 LCP1P13796 627 aa8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 RGS7P49802 495 aa8.02□□□□□ -1.13
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SGMS1-201ENST00000361543 SPEM2Q0P670 501 aa8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 CNGA2Q16280 664 aa8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 DPCR1Q3MIW9 517 aa8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 C10orf76Q5T2E6 689 aa8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 GRAMD4Q6IC98 578 aa8.02□□□□□ -1.13
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SGMS1-201ENST00000361543 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM65Q6PJ69 517 aa8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 TPGS1Q6ZTW0 290 aa8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 NUDT18Q6ZVK8 323 aa8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 IRF2BP1Q8IU81 584 aa8.02□□□□□ -1.13
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SGMS1-201ENST00000361543 PLPP6Q8IY26 295 aa8.02□□□□□ -1.13
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SGMS1-201ENST00000361543 KCTD13Q8WZ19 329 aa8.02□□□□□ -1.13
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SGMS1-201ENST00000361543 EDEM1Q92611 657 aa8.02□□□□□ -1.13
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SGMS1-201ENST00000361543 SDK1Q7Z5N4 2213 aa8.02□□□□□ -1.13
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SGMS1-201ENST00000361543 SLC12A8A0AV02 714 aa8.01□□□□□ -1.13
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SGMS1-201ENST00000361543 PIK3R2O00459 728 aa8.01□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM24O15164 1050 aa8.01□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 LRP3O75074 770 aa8.01□□□□□ -1.13
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SGMS1-201ENST00000361543 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
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SGMS1-201ENST00000361543 DGKEP52429 567 aa8.01□□□□□ -1.13
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SGMS1-201ENST00000361543 EMC10Q5UCC4 262 aa8.01□□□□□ -1.13
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SGMS1-201ENST00000361543 KBTBD6Q86V97 674 aa8.01□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 RASSF3Q86WH2 238 aa8.01□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 DENND1CQ8IV53 801 aa8.01□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 FMNL3Q8IVF7 1028 aa8.01□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 SCML4Q8N228 414 aa8.01□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 MDGA1Q8NFP4 955 aa8.01□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 RNF139Q8WU17 664 aa8.01□□□□□ -1.13
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