RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 NR1H2P55055 460 aa17.38■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 CDK18Q07002 472 aa17.38■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 TUBB3Q13509 450 aa17.38■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 TFDP3Q5H9I0 405 aa17.38■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa17.38■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 SV2AQ7L0J3 742 aa17.38■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 AMIGO2Q86SJ2 522 aa17.38■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 MAP4K3Q8IVH8 894 aa17.38■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa17.38■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 THEGQ9P2T0 379 aa17.38■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 TRPA1O75762 1119 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 HDAC4P56524 1084 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 BASP1P80723 227 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 PPM1NQ8N819 430 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 FEZF2Q8TBJ5 459 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 DDI1Q8WTU0 396 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 SENP7Q9BQF6 1050 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 EXOC7Q9UPT5 735 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 A0A1B0GTW7 788 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 PORP16435 677 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 ITGAXP20702 1163 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 GCNT1Q02742 428 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 SYCP2LQ5T4T6 812 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 Q6ZNX1 250 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 ZNF280CQ8ND82 737 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 ACTL9Q8TC94 416 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 TMEM174Q8WUU8 243 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 RSPH1Q8WYR4 309 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 FAM213AQ9BRX8 229 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 RAB26Q9ULW5 256 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 SCINQ9Y6U3 715 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 KAT6AQ92794 2004 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 F8VP50 259 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 SIN3BO75182 1162 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 FAM58BPP0C7Q3 252 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 CDKN2BP42772 138 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 STT3AP46977 705 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 CD151P48509 253 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 OXCT1P55809 520 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 NOMO3P69849 1222 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 GSTM4Q03013 218 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 BMPR2Q13873 1038 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 MTERF2Q49AM1 385 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 C6orf52Q5T4I8 152 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 ZNF677Q86XU0 584 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 IP6K2Q9UHH9 426 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 ITGA11Q9UKX5 1188 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 PSMD13Q9UNM6 376 aa17.37■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 LOC100653049A0A140TA62 436 aa17.36■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 ZMPSTE24O75844 475 aa17.36■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 KRT34O76011 436 aa17.36■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 KCNA2P16389 499 aa17.36■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 PTPRAP18433 802 aa17.36■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 STX3Q13277 289 aa17.36■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 TMEM132BQ14DG7 1078 aa17.36■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 SLC26A11Q86WA9 606 aa17.36■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 FBXW8Q8N3Y1 598 aa17.36■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 MMP19Q99542 508 aa17.36■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 PACSIN3Q9UKS6 424 aa17.36■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 TRIM43BA6NCK2 446 aa17.36■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 KLHL2O95198 593 aa17.36■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 RBP3P10745 1247 aa17.36■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 CCR3P51677 355 aa17.36■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 NRLP54845 237 aa17.36■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 MTTPP55157 894 aa17.36■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa17.36■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 RSAD2Q8WXG1 361 aa17.36■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 NLRP4Q96MN2 994 aa17.36■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa17.36■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 C1orf112Q9NSG2 853 aa17.36■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 SH3PXD2BA1X283 911 aa17.35■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 TSHRP16473 764 aa17.35■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 BAG6P46379 1132 aa17.35■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 NAA20P61599 178 aa17.35■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 PRKCEQ02156 737 aa17.35■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 CFAP36Q96G28 342 aa17.35■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 ZNF778Q96MU6 729 aa17.35■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 ZNF180Q9UJW8 692 aa17.35■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 TOM1L1O75674 476 aa17.35■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 KRT37O76014 449 aa17.35■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
GDE1-201ENST00000353258 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms