RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328596.10

TNFRSF18-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 18, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF18, Length 851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18-201ENST00000328596 CDKAL1Q5VV42 579 aa21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF18-201ENST00000328596 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF18-201ENST00000328596 SFTPA1Q8IWL2 248 aa21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF18-201ENST00000328596 CAMKK1Q8N5S9 505 aa21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF18-201ENST00000328596 CLEC4CQ8WTT0 213 aa21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF18-201ENST00000328596 GOLGA1Q92805 767 aa21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF18-201ENST00000328596 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF18-201ENST00000328596 ST7Q9NRC1 585 aa21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF18-201ENST00000328596 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF18-201ENST00000328596 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF18-201ENST00000328596 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF18-201ENST00000328596 CACNG3O60359 315 aa21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 LTFP02788 710 aa21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 CNR2P34972 360 aa21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 CHKAP35790 457 aa21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 MYL5Q02045 173 aa21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 PTK2Q05397 1052 aa21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 DMC1Q14565 340 aa21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 WDR5BQ86VZ2 330 aa21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 DENND1CQ8IV53 801 aa21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 BPIFA3Q9BQP9 254 aa21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 SLC4A5Q9BY07 1137 aa21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 MIS12Q9H081 205 aa21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 TAB2Q9NYJ8 693 aa21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 TBC1D3BA6NDS4 549 aa21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 ANTXRLA6NF34 631 aa21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 SART1O43290 800 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 GRAMD4Q6IC98 578 aa21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 MSANTD2Q6P1R3 559 aa21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 NUDT18Q6ZVK8 323 aa21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 SCUBE3Q8IX30 993 aa21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 HHIPQ96QV1 700 aa21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 FANCLQ9NW38 375 aa21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 CYTH4Q9UIA0 394 aa21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 GPR179Q6PRD1 2367 aa21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 HRO43593 1189 aa21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 TPM2P07951 284 aa21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 HARS2P49590 506 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 KRT31Q15323 416 aa21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 TMEM110Q86TL2 294 aa21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 FAM71AQ8IYT1 594 aa21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 TERB1Q8NA31 727 aa21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 RUBCNQ92622 972 aa21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 VPS16Q9H269 839 aa21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 MMP17Q9ULZ9 603 aa21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 PCDHGC3Q9UN70 934 aa21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 TRIM24O15164 1050 aa21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 CLCN1P35523 988 aa21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 TIE1P35590 1138 aa21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 PXNP49023 591 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 PDCLQ13371 301 aa21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 RAPGEF1Q13905 1077 aa21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 EMC10Q5UCC4 262 aa21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 FAM217AQ8IXS0 508 aa21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 CPXM2Q8N436 756 aa21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 CCDC33Q8N5R6 958 aa21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 KCNV2Q8TDN2 545 aa21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 BHMTQ93088 406 aa21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 PLK2Q9NYY3 685 aa21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 FHOD1Q9Y613 1164 aa21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 E5RJQ4 531 aa21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 MSI1O43347 362 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 APBB3O95704 486 aa21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 PENKP01210 267 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 NCAM1P13591 858 aa21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 UCHL3P15374 230 aa21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 ZNF165P49910 485 aa21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 BPIFB4P59827 614 aa21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 NCAPHQ15003 741 aa21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 C10orf76Q5T2E6 689 aa21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 FYB2Q5VWT5 728 aa21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 SLC47A2Q86VL8 602 aa21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 ALLCQ8N6M5 410 aa21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 IL17RCQ8NAC3 791 aa21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 FAM149B1Q96BN6 582 aa21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 P2RY11Q96G91 374 aa21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 HINFPQ9BQA5 517 aa21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 TRIM62Q9BVG3 475 aa21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF18-201ENST00000328596 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms