RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320122.10

LMO3-202, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,759 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-202ENST00000320122 PORCNQ9H237 461 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 C8orf4Q9NR00 106 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 ZNF302Q9NR11 478 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 PHF24Q9UPV7 400 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 SDR42E2A6NKP2 422 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 IRF6O14896 467 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 DENRO43583 198 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 MPOP05164 745 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 NR3C2P08235 984 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 CYP2C8P10632 490 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 IMPDH2P12268 514 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 PROZP22891 400 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 AMPD1P23109 780 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 SDC4P31431 198 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 ACOT2P49753 483 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 DPYSQ14117 519 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 HERC3Q15034 1050 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 IER5Q5VY09 327 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 CASC4Q6P4E1 433 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 TRIML2Q8N7C3 387 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 RDH11Q8TC12 318 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 ACER1Q8TDN7 264 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 NRG4Q8WWG1 115 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 SERAC1Q96JX3 654 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 ZNF670Q9BS34 389 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 APOL6Q9BWW8 343 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 TRIM15Q9C019 465 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 LRCH4O75427 683 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 OATP04181 439 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 APRTP07741 180 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 KITP10721 976 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 RALBP11234 206 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 RAG1P15918 1043 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 DNAJB1P25685 340 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 CHRNA5P30532 468 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 ALDH1A3P47895 512 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 RPS6P62753 249 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 COG7P83436 770 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 ARHGAP8P85298 464 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 GRTP1Q5TC63 336 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 ANKRD22Q5VYY1 191 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 LRRC43Q8N309 656 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 KYQ8NBH2 561 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 MPP4Q96JB8 637 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 FAR2Q96K12 515 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 SDCBP2Q9H190 292 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 ETNK2Q9NVF9 386 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 PIM2Q9P1W9 311 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 HESX1Q9UBX0 185 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 NUB1Q9Y5A7 615 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 FAM159BA6NKW6 160 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 PIK3R2O00459 728 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 TMEM63AO94886 807 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 HARSP12081 509 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 TYK2P29597 1187 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 ARL4AP40617 200 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 KRT80Q6KB66 452 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 SLC39A4Q6P5W5 647 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 ARPINQ7Z6K5 226 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 VSIG10LQ86VR7 867 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 UNC45BQ8IWX7 931 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 RNF157Q96PX1 679 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 KIFC3Q9BVG8 833 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 EFCAB1Q9HAE3 211 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 RNF146Q9NTX7 359 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 STK39Q9UEW8 545 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 CDH22Q9UJ99 828 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-202ENST00000320122 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
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