RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308478.9

LRRN3-201, Transcript of leucine rich repeat neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRN3, Length 3,099 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3-201ENST00000308478 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 CDH3P22223 829 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 FGFR3P22607 806 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 HMOX2P30519 316 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 CDKN2BP42772 138 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 DPYSL3Q14195 570 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 SLFN13Q68D06 897 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 GPR141Q7Z602 305 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 FBXL8Q96CD0 374 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 FAF2Q96CS3 445 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 PLEKHA8Q96JA3 519 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 SERPINI1Q99574 410 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 NEURL2Q9BR09 285 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 CDC14AQ9UNH5 594 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 SCINQ9Y6U3 715 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 SMCHD1A6NHR9 2005 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 E2F8A0AVK6 867 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 TMEM150BA6NC51 233 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 WDR46O15213 610 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 NDUFB5O43674 189 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 KRT38O76015 456 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 ZBED1O96006 694 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 EPHA3P29320 983 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 GNA15P30679 374 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 CA8P35219 290 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 THOP1P52888 689 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 ITPK1Q13572 414 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 ABCB5Q2M3G0 1257 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 WDR44Q5JSH3 913 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 FAXCQ5TGI0 409 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 TATDN1Q6P1N9 297 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 MIER3Q7Z3K6 550 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 ATP2A3Q93084 1043 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 RANBP9Q96S59 729 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF577Q9BSK1 485 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 STRA6Q9BX79 667 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 KLC2Q9H0B6 622 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 RNF11Q9Y3C5 154 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 ZHX2Q9Y6X8 837 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 SCN7AQ01118 1682 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 NAV1Q8NEY1 1877 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 C7orf72A4D263 438 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 GOLGA8OA6NCC3 632 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 GOLGA8NF8WBI6 632 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 PSMD10O75832 226 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 UGT1A6P19224 532 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 UGT1A1P22309 533 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 UGT1A4P22310 534 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 UGT1A3P35503 534 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 UGT1A5P35504 534 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 HSPA13P48723 471 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 ACADVLP49748 655 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 SIK1P57059 783 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 MS4A2Q01362 244 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 PPP2R5DQ14738 602 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 NFIXQ14938 502 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 CEP55Q53EZ4 464 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 NANOGP8Q6NSW7 305 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 MAVSQ7Z434 540 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 RFX6Q8HWS3 928 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 ADGRF2Q8IZF7 708 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 LZTR1Q8N653 840 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 FAM156AQ8NDB6 213 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 BORCS5Q969J3 196 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 ISOC1Q96CN7 298 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 SNX27Q96L92 541 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms