RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 KRT3P12035 628 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 ABCB4P21439 1286 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 NOS2P35228 1153 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 MATKP42679 507 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 GSE1Q14687 1217 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 EMC1Q8N766 993 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF653Q96CK0 615 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 SERPINB11Q96P15 392 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 FAM204AQ9H8W3 233 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 SPTLC3Q9NUV7 552 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM59LQ9UK28 342 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 DUSP12Q9UNI6 340 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 WNT6Q9Y6F9 365 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 E2F8A0AVK6 867 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 CHADO15335 359 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 STC2O76061 302 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 SRFP11831 508 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 FLT3P36888 993 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM11Q96F44 468 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 COX16Q9P0S2 106 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 STAP1Q9ULZ2 295 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 IFNAR2P48551 515 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM68Q6AZZ1 485 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 JOSD2Q8TAC2 188 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 IRF7Q92985 503 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 PLD4Q96BZ4 506 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 ASIC4Q96FT7 647 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 MYO1AQ9UBC5 1043 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 SIGLEC16A6NMB1 481 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 MYBL1P10243 752 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 SULT1E1P49888 294 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 TBX4P57082 545 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 TRNP1Q6NT89 227 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 DCUN1D2Q6PH85 259 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 ARCQ7LC44 396 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 OSCP1Q8WVF1 389 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 CFAP57Q96MR6 1250 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 MCEEQ96PE7 176 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 LINC00597Q9H2U6 94 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 EBF3Q9H4W6 596 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 PARVAQ9NVD7 372 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 DDIT4Q9NX09 232 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 RRN3Q9NYV6 651 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 NENFQ9UMX5 172 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 M0QYT0 321 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 IRAK2O43187 625 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 GBP1P32455 592 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 HARS2P49590 506 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 NME3Q13232 169 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 HTR3DQ70Z44 454 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 BBS7Q8IWZ6 715 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 UBALD2Q8IYN6 164 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 RXFP2Q8WXD0 754 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 FAM83CQ9BQN1 747 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 THAP2Q9H0W7 228 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 TBC1D14Q9P2M4 693 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 TLR6Q9Y2C9 796 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 COL4A2P08572 1712 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD62A6NC57 917 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD4-201ENST00000306324 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
HOXD4-201ENST00000306324 IGLV3-25P01717 112 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD4-201ENST00000306324 PDGFRAP16234 1089 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD4-201ENST00000306324 GALCP54803 685 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD4-201ENST00000306324 GSDMDP57764 484 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD4-201ENST00000306324 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
HOXD4-201ENST00000306324 PFKPQ01813 784 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD4-201ENST00000306324 TNK2Q07912 1038 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD4-201ENST00000306324 MAMLD1Q13495 774 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD4-201ENST00000306324 PDGFRLQ15198 375 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD4-201ENST00000306324 SLC25A52Q3SY17 297 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD4-201ENST00000306324 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD4-201ENST00000306324 TMTC1Q8IUR5 882 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD4-201ENST00000306324 DENND1CQ8IV53 801 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD4-201ENST00000306324 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD4-201ENST00000306324 TBCBQ99426 244 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD4-201ENST00000306324 NPY6RQ99463 290 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD4-201ENST00000306324 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
HOXD4-201ENST00000306324 DCLK3Q9C098 648 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD4-201ENST00000306324 MIA3Q5JRA6 1907 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD4-201ENST00000306324 SOWAHDA6NJG2 315 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXD4-201ENST00000306324 C2CD4BA6NLJ0 364 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXD4-201ENST00000306324 DCXO43602 365 aa23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms