RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 NCKAP1LP55160 1127 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 OASLQ15646 514 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 SLC44A4Q53GD3 710 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 AGKQ53H12 422 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 VPS33AQ96AX1 596 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 PRKD2Q9BZL6 878 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 A0A087WZ62 844 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 CD151P48509 253 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 TKTL1P51854 596 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC142Q17RM4 750 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 KCNQ5Q9NR82 932 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 AK9Q5TCS8 1911 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 GYS1P13807 737 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 SLC1A6P48664 564 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 PSMD7P51665 324 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 MAP3K7CLP57077 242 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 LRRN4CLQ8ND94 238 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 SCUBE2Q9NQ36 999 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 TSPAN16Q9UKR8 245 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 PLA2G6O60733 806 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 PAEPP09466 180 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 SLC34A1Q06495 639 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 POLG2Q9UHN1 485 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 TECPR2O15040 1411 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 RASSF9O75901 435 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 PDE5AO76074 875 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 DDHD2O94830 711 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 GUCA1CO95843 209 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 PGAM1P18669 254 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 GTF2A2P52657 109 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 TAF2Q6P1X5 1199 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 TMCC3Q9ULS5 477 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 SAC3D1A6NKF1 404 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 FAM86B1E9PN63 330 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 FAM86B2P0C5J1 330 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 YY1P25490 414 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 RRM2P31350 389 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 MFSD7Q6UXD7 560 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 CPB2Q96IY4 423 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 ADGRE3Q9BY15 652 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 PRKCIP41743 596 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 FAM83AQ86UY5 434 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 HTR3CQ8WXA8 447 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM169Q96HH4 297 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 SAR1AQ9NR31 198 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 TRHDEQ9UKU6 1024 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 SASH3O75995 380 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 PLIN5Q00G26 463 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 ATP9AO75110 1047 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 IFNA14P01570 189 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 LRG1P02750 347 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 NPY2RP49146 381 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM132BQ14DG7 1078 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 CASP10Q92851 521 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 LRCH1Q9Y2L9 728 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 CDK7P50613 346 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 NAB1Q13506 487 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 PRMT9Q6P2P2 845 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 RSPH1Q8WYR4 309 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 USE1Q9NZ43 259 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 SIK3Q9Y2K2 1263 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 SPANXN3Q5MJ09 141 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHH3Q7Z736 793 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 BRSK2Q8IWQ3 736 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJC18Q9H819 358 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 MAP3K13O43283 966 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 KRT75O95678 551 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 ALADP13716 330 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJB2P25686 324 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 SSTR1P30872 391 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 ARL4DP49703 201 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 NME5P56597 212 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 ILDR2Q71H61 639 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 NT5MQ9NPB1 228 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 HOXA2O43364 376 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 SOX6P35712 828 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 NDST1P52848 882 aa21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms