RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 SPDYE6P0CI01 402 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SPRP35270 261 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 HADHAP40939 763 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF284Q2VY69 593 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 C4orf50Q6ZRC1 276 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ANKRD23Q86SG2 305 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SMYD1Q8NB12 490 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 DAGLBQ8NCG7 672 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SNX19Q92543 992 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 C17orf75Q9HAS0 396 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ACTL7BQ9Y614 415 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 NADKO95544 446 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 LDLRP01130 860 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 VCLP18206 1134 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 EFHC2Q5JST6 749 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 C6orf10Q5SRN2 563 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 CCDC36Q8IYA8 594 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ARHGEF26Q96DR7 871 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 NSMCE3Q96MG7 304 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 GNPTGQ9UJJ9 305 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 APOL1O14791 398 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 PROCP04070 461 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 PPP4CP60510 307 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 NIPAL1Q6NVV3 410 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 USP17L6PQ6QN14 398 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 CHST13Q8NET6 341 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SGF29Q96ES7 293 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 BTBD9Q96Q07 612 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 LMCD1Q9NZU5 365 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 CLDN25C9JDP6 229 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 IL18RAPO95256 599 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 FKBP9O95302 570 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 RARAP10276 462 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SLC5A3P53794 718 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ACTR2P61160 394 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 NCF4Q15080 339 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 GALNT18Q6P9A2 607 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 MOXD1Q6UVY6 613 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 FKBP9P1Q75LS8 142 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 FBXO33Q7Z6M2 555 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 FAM45AQ8TCE6 357 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ZSWIM1Q9BR11 485 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 EPB41L1Q9H4G0 881 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 TASP1Q9H6P5 420 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SP140LQ9H930 580 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 DYRK4Q9NR20 520 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 PLCL2Q9UPR0 1127 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 COQ9O75208 318 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 KLK7P49862 253 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SPP2Q13103 211 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 CENPPQ6IPU0 288 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ANO7Q6IWH7 933 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 OXER1Q8TDS5 423 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 GNA15P30679 374 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 BCAR1P56945 870 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 HAUS6Q7Z4H7 955 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 RAB43Q86YS6 212 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 POU5F2Q8N7G0 328 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 KBTBD8Q8NFY9 601 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 PGBD4Q96DM1 585 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 C17orf80Q9BSJ5 609 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 GOLPH3Q9H4A6 298 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SLC16A4O15374 487 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 GABBR2O75899 941 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 RALBP11234 206 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF677Q86XU0 584 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 PAFAH2Q99487 392 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SERHL2Q9H4I8 314 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SERHLQ9NQF3 203 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 FAM53CQ9NYF3 392 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SLC26A3P40879 764 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SNAP25P60880 206 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 FAM213AQ9BRX8 229 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 FLT1P17948 1338 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 MYO3AQ8NEV4 1616 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SNAP91O60641 907 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms