RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263202.14

UFD1-201, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UFD1, Length 1,814 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1-201ENST00000263202 GBP1P32455 592 aa23.6■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 PTPN7P35236 360 aa23.6■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 CETN2P41208 172 aa23.6■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 CA9Q16790 459 aa23.6■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 TDHQ8IZJ6 230 aa23.6■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 PDZD8Q8NEN9 1154 aa23.6■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 PSMG2Q969U7 264 aa23.6■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa23.6■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 CHD7Q9P2D1 2997 aa23.6■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 KRIT1O00522 736 aa23.59■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 IRAK2O43187 625 aa23.59■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 C8AP07357 584 aa23.59■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 CXCR3P49682 368 aa23.59■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 CDH6P55285 790 aa23.59■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 TAF12Q16514 161 aa23.59■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 TAZQ16635 292 aa23.59■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 TFDP3Q5H9I0 405 aa23.59■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa23.59■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 HEMGNQ9BXL5 484 aa23.59■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 AP4E1Q9UPM8 1137 aa23.59■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 NR2E1Q9Y466 385 aa23.59■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa23.59■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 KRT10P13645 584 aa23.59■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 PPP2R5EQ16537 467 aa23.59■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 SNX30Q5VWJ9 437 aa23.59■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 FAM71BQ8TC56 605 aa23.59■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 ARNTL2Q8WYA1 636 aa23.59■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 SLC28A3Q9HAS3 691 aa23.59■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 DENND4CQ5VZ89 1909 aa23.58■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 C1RP00736 705 aa23.58■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 PDK2Q15119 407 aa23.58■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 DPYSL2Q16555 572 aa23.58■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 ITIH5Q86UX2 942 aa23.58■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 NTAN1Q96AB6 310 aa23.58■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 MAGEB5Q9BZ81 275 aa23.58■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 PCDH18Q9HCL0 1135 aa23.58■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 ANLNQ9NQW6 1124 aa23.58■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa23.58■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 ASB3Q9Y575 518 aa23.58■■□□□ 1.37
UFD1-201ENST00000263202 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 CTIFO43310 598 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 LRG1P02750 347 aa23.57■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 L1CAMP32004 1257 aa23.57■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 ADRA1BP35368 520 aa23.57■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 AIF1P55008 147 aa23.57■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 DPYSL3Q14195 570 aa23.57■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 KRT81Q14533 505 aa23.57■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 ZNF276Q8N554 614 aa23.57■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 SERPINB11Q96P15 392 aa23.57■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 CALN1Q9BXU9 219 aa23.57■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 WDCPQ9H6R7 721 aa23.57■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 MTMR10Q9NXD2 777 aa23.57■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 V9GYY5 206 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 ZNF840PA6NDX5 716 aa23.56■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 CCDC188H7C350 402 aa23.56■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 I6L893 689 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 MSI1O43347 362 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 TERF1P54274 439 aa23.56■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 ADCY2Q08462 1091 aa23.56■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 KAZNQ674X7 775 aa23.56■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 MAP7D3Q8IWC1 876 aa23.56■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 MMGT1Q8N4V1 131 aa23.56■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 CCSER2Q9H7U1 834 aa23.56■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 EFR3BQ9Y2G0 817 aa23.56■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 TLR5O60602 858 aa23.56■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 TBX18O95935 607 aa23.56■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 SCAPQ12770 1279 aa23.56■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 MMRN1Q13201 1228 aa23.56■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 C10orf120Q5SQS8 335 aa23.56■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 TEX35Q5T0J7 233 aa23.56■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 GDPD5Q8WTR4 605 aa23.56■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 SLC22A17Q8WUG5 538 aa23.56■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 MAIP1Q8WWC4 291 aa23.56■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 LMAN2LQ9H0V9 348 aa23.56■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa23.56■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 EPOPA6NHQ4 379 aa23.55■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 IL4RP24394 825 aa23.55■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 PPP3CCP48454 512 aa23.55■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 EFEMP1Q12805 493 aa23.55■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 ARL13BQ3SXY8 428 aa23.55■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 VSIG1Q86XK7 387 aa23.55■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 PYROXD2Q8N2H3 581 aa23.55■■□□□ 1.36
UFD1-201ENST00000263202 PRELID2Q8N945 189 aa23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms