RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 KLHL32Q96NJ5 620 aa16.49■□□□□ 0.23
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CTIF-201ENST00000256413 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP16.49■□□□□ 0.234e-7■■■■□ 25.2
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CTIF-201ENST00000256413 KBTBD13C9JR72 458 aa16.48■□□□□ 0.23
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CTIF-201ENST00000256413 ACTL9Q8TC94 416 aa16.48■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 FBXO28Q9NVF7 368 aa16.48■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa16.48■□□□□ 0.23
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CTIF-201ENST00000256413 COX4I1P13073 169 aa16.47■□□□□ 0.23
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CTIF-201ENST00000256413 TTC23Q5W5X9 447 aa16.47■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 LPCAT4Q643R3 524 aa16.47■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 C11orf88Q6PI97 169 aa16.47■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 UGT2B28Q9BY64 529 aa16.47■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 PHACTR1Q9C0D0 580 aa16.47■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
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CTIF-201ENST00000256413 UPP2O95045 317 aa16.47■□□□□ 0.23
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CTIF-201ENST00000256413 IL6P05231 212 aa16.47■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 MYL4P12829 197 aa16.47■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 ZNF12P17014 697 aa16.47■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 CRKP46108 304 aa16.47■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 KLRC3Q07444 240 aa16.47■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 MPP3Q13368 585 aa16.47■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 PCSK7Q16549 785 aa16.47■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 DUPD1Q68J44 220 aa16.47■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 FIG4Q92562 907 aa16.47■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 MED15Q96RN5 788 aa16.47■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 S100A14Q9HCY8 104 aa16.47■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 PCYOX1Q9UHG3 505 aa16.47■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 DUSP12Q9UNI6 340 aa16.47■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa16.47■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa16.47■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 FAM45AQ8TCE6 357 aa16.47■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 NIF3L1Q9GZT8 377 aa16.47■□□□□ 0.23
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CTIF-201ENST00000256413 SPON2Q9BUD6 331 aa16.46■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 ARL8BQ9NVJ2 186 aa16.46■□□□□ 0.23
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CTIF-201ENST00000256413 DISP1Q96F81 1524 aa16.46■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 KLHL33A6NCF5 533 aa16.46■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 MT-CO1P00395 513 aa16.46■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 RTP1P59025 263 aa16.46■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 SPIRE1Q08AE8 756 aa16.46■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 CUL2Q13617 745 aa16.46■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 QPRTQ15274 297 aa16.46■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 KCNV1Q6PIU1 500 aa16.46■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 WDR59Q6PJI9 974 aa16.46■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
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