RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 TRIM61Q5EBN2 209 aa22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 LYSMD4Q5XG99 296 aa22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 ARMCX6Q7L4S7 300 aa22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 ACOX2Q99424 681 aa22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 ARID3AQ99856 593 aa22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 GABRG3Q99928 467 aa22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 PLK2Q9NYY3 685 aa22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 STRIP2Q9ULQ0 834 aa22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 PI4KAP42356 2102 aa22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 HOXD12P35452 270 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 CBWD6Q4V339 395 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 CBWD3Q5JTY5 395 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 BHMTQ93088 406 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 SMARCE1Q969G3 411 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM74BQ9NUR3 256 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 MARCH2Q9P0N8 246 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 CACNA1BQ00975 2339 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 ZBED1O96006 694 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 PENKP01210 267 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 HMBSP08397 361 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 TKTL1P51854 596 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 LRRC63Q05C16 580 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 CUL2Q13617 745 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 E2F5Q15329 346 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 SGO2Q562F6 1265 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 PM20D1Q6GTS8 502 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 SLC23A3Q6PIS1 610 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 CEP76Q8TAP6 659 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 SPATA20Q8TB22 786 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 HESX1Q9UBX0 185 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 PILRBQ9UKJ0 227 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 NPC1O15118 1278 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 CYBBP04839 570 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 NUCB2P80303 420 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 SHC2P98077 582 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 BECN1Q14457 450 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 FYB2Q5VWT5 728 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 UCMAQ8WVF2 138 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 TIGD1Q96MW7 591 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 LRRC4Q9HBW1 653 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 CD248Q9HCU0 757 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 KIAA1257Q9ULG3 409 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 CEP192Q8TEP8 1941 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 EPG5Q9HCE0 2579 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 SLC12A8A0AV02 714 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 CEACAM1P13688 526 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 NDUFV2P19404 249 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 ITPKAP23677 461 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF132P52740 706 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 BCAT1P54687 386 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF33AQ06730 810 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 PDE4CQ08493 712 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 STIM1Q13586 685 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 DUOXA1Q1HG43 343 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 UAP1L1Q3KQV9 507 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 KIAA1211LQ6NV74 962 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 RABEPKQ7Z6M1 372 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 DENND1CQ8IV53 801 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 ULBP1Q9BZM6 244 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 VDRP11473 427 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 CD19P15391 556 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 MFAP3P55082 362 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 BST2Q10589 180 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 STARD3Q14849 445 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 ST3GAL2Q16842 350 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 CPXM2Q8N436 756 aa22.05■■□□□ 1.12
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