RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000111980.3

Hoxd4-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd4, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Brpf3B2KF05 1204 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nr3c1P06537 783 aa20.54■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 JundP15066 341 aa20.54■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mxi1P50540 228 aa20.54■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ttc39dQ0VF76 604 aa20.54■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mef2dQ63943 514 aa20.54■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Wee2Q66JT0 555 aa20.54■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Trim62Q80V85 475 aa20.54■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ankrd52Q8BTI7 1076 aa20.54■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Afap1l1Q8BZI0 768 aa20.54■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sh3rf2Q8BZT2 735 aa20.54■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Asic2Q925H0 512 aa20.54■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tpd52l2Q9CYZ2 220 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nol7Q9D7Z3 254 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Trim10Q9WUH5 489 aa20.54■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PtprdQ64487 1912 aa20.53■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Scn8aQ9WTU3 1978 aa20.53■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cnbd1B1AWM0 430 aa20.53■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ccdc149F6V035 524 aa20.53■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Vmn1r176G3UW31 304 aa20.53■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sclt1G5E861 688 aa20.53■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 ChadO55226 358 aa20.53■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Xrcc5P27641 732 aa20.53■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zfp217Q3U0X6 1041 aa20.53■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Agap2Q3UHD9 1186 aa20.53■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Bahd1Q497V6 772 aa20.53■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ago1Q8CJG1 857 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sytl2Q99N50 950 aa20.53■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 FignQ9ERZ6 759 aa20.53■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 TfgQ9Z1A1 397 aa20.53■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Il17dA0A0B4J1G4 205 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm4297D3YWB7 211 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 FancfE9Q5Z5 343 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Usp2O88623 613 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ap2a2P17427 938 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 GssP51855 474 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Lrig2Q52KR2 1054 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Hspa4Q61316 841 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sema5aQ62217 1077 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Myo6Q64331 1265 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 AtminQ6P9S1 818 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Q6PAC4 1279 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cspg5Q71M36 566 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zdhhc17Q80TN5 632 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Necab1Q8BG18 352 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Arid5bQ8BM75 1188 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pcyox1lQ8C7K6 495 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc25a3Q8VEM8 357 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Unc45aQ99KD5 944 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Raver1Q9CW46 748 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rnf225Q9D7D1 332 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cyp2c55Q9D816 490 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dcaf6Q9DC22 876 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sertad2Q9JJG5 309 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sec14l1A8Y5H7 715 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 LipeP54310 759 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Smpdl3aP70158 445 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ccdc185Q3V118 621 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 NntQ61941 1086 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 KaznQ69ZS8 779 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fam102aQ78T81 392 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nop9Q8BMC4 636 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 MmaaQ8C7H1 415 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PigxQ99LV7 254 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Scube2Q9JJS0 997 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 NbnQ9R207 751 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zfp40B1B1D3 796 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ptp4a2O70274 167 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 NsfP46460 744 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Anks1aP59672 1150 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 AxlQ00993 888 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cdk7Q03147 346 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Osbpl6Q8BXR9 959 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tmem132cQ8CEF9 1099 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Lrrc45Q8CIM1 670 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ophn1Q99J31 802 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 CatsperzQ9CQP8 194 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 CabyrQ9D424 453 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Asap1Q9QWY8 1147 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pi4kaE9Q3L2 2105 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zfp626A0A0U1RQ84 676 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tmem235B1AQL3 211 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fam184aE9PW83 1143 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dthd1E9PZX1 795 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm10722F6VLK5 217 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ring1O35730 406 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ptger1P35375 405 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rhox5P52651 210 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gjb5Q02739 271 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Col9a1Q05722 921 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Specc1lQ2KN98 1118 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cfhr2Q4LDF6 332 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Satb1Q60611 764 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Stip1Q60864 543 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kxd1Q80XH1 177 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Q8BZE1 841 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Thop1Q8C1A5 687 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cyp2d26Q8CIM7 500 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Commd10Q8JZY2 202 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Asb2Q8K0L0 634 aa20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.7 ms