RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019722.11

Ubxn6-201, Transcript of UBX domain-containing protein 6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubxn6, Length 2,949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 ADGRF3Q58Y75 991 aa11.48□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Nab1Q61122 486 aa11.48□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ddr2Q62371 854 aa11.48□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Utp14bQ6EJB6 756 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Plppr4Q7TME0 766 aa11.48□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 WtipQ7TQJ8 398 aa11.48□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Supt20hQ7TT00 530 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Lin52Q8CD94 116 aa11.48□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Snrnp27Q8K194 155 aa11.48□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Chst12Q99LL3 419 aa11.48□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Krt20Q9D312 431 aa11.48□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Tmem59Q9QY73 323 aa11.48□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Myo18aQ9JMH9 2050 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Psma2P49722 234 aa11.48□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Mrgprx2Q3UG50 352 aa11.48□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Htr1aQ64264 421 aa11.48□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Olfr299Q7TS05 330 aa11.48□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Vmn1r213Q8R278 384 aa11.48□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Tspan8Q8R3G9 235 aa11.48□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Wdr98Q8VC42 657 aa11.48□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Lypd3Q91YK8 363 aa11.48□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Trps1Q925H1 1281 aa11.48□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ggt7Q99JP7 662 aa11.48□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Nmd3Q99L48 503 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Commd8Q9CZG3 183 aa11.48□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Polr3hQ9D2C6 204 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Magel2Q9QZ04 1284 aa11.48□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 TfebQ9R210 475 aa11.48□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Mtm1Q9Z2C5 603 aa11.48□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Smok3cA0A087WSF2 504 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Rabgap1lA6H6A9 815 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Apol11aE9PZG0 334 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 DcxO88809 366 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 PrkcdP28867 674 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Fmo3P97501 534 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Adrbk2Q3UYH7 688 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ankrd6Q69ZU8 712 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Pggt1bQ8BUY9 377 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Rsl1d1Q8BVY0 452 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Cox16Q9CR63 106 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Tubb3Q9ERD7 450 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Hey2Q9QUS4 339 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 TfgQ9Z1A1 397 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 1700031M16RikA0A087WSH0 82 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Arhgef26D3YYY8 869 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Mroh4G3X8W1 983 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Tnfrsf11bO08712 401 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 AlbP07724 608 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Cap1P40124 474 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Lhx5P61375 402 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 HmgcrQ01237 887 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Cdk7Q03147 346 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Tmed1Q3V009 227 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Cfhr2Q4LDF6 332 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Klra8Q60682 266 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 IqceQ6PCQ0 778 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Acot5Q6Q2Z6 421 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gpr150Q8BL07 427 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Panx3Q8CEG0 392 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Mamdc2Q8CG85 686 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Sh3kbp1Q8R550 709 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ak5Q920P5 562 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Fam49bQ921M7 324 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 NonoQ99K48 473 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Mcrs1Q99L90 462 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 CoprsQ9CQ13 173 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Wars2Q9CYK1 360 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Med7Q9CZB6 233 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Tbx20Q9ES03 445 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Dach1Q9QYB2 751 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Sned1Q70E20 1403 aa11.47□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ptpn3A2ALK8 913 aa11.46□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Has3O08650 554 aa11.46□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Hcn2O88703 863 aa11.46□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Cd2P08920 344 aa11.46□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ccr1P51675 355 aa11.46□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Adcy6Q01341 1165 aa11.46□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Srrm1Q52KI8 946 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm11437Q5QR91 290 aa11.46□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Rad54bQ6PFE3 886 aa11.46□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Klhl17Q6TDP3 640 aa11.46□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gramd1bQ80TI0 738 aa11.46□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Pgm5Q8BZF8 567 aa11.46□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 ItchQ8C863 864 aa11.46□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ablim1Q8K4G5 861 aa11.46□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Snrnp25Q8VIK1 123 aa11.46□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Prkag2Q91WG5 566 aa11.46□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 GsdmcQ99NB5 468 aa11.46□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Thg1lQ9CY52 298 aa11.46□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Rpap3Q9D706 660 aa11.46□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Scyl3Q9DBQ7 735 aa11.46□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Dmap1Q9JI44 468 aa11.46□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Zbtb12Q9Z150 459 aa11.46□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Sbno2Q7TNB8 1349 aa11.46□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ep400Q8CHI8 3072 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Olfr271-ps1A0A1L1SQH2 283 aa11.46□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm28043E0CXC2 719 aa11.46□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Zfp946F6VWU8 523 aa11.46□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm3187M0QWW3 260 aa11.46□□□□□ -0.57
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 EsrraO08580 422 aa11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.8 ms