RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 ADORA2BP29275 332 aa23.25■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 PTGER3P43115 390 aa23.25■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 PNOCQ13519 176 aa23.25■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa23.25■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 IL17RCQ8NAC3 791 aa23.25■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 RLN3Q8WXF3 142 aa23.25■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 CYFIP2Q96F07 1278 aa23.25■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 PNKPQ96T60 521 aa23.25■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 RMND1Q9NWS8 449 aa23.25■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 LHX6Q9UPM6 363 aa23.25■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa23.25■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa23.25■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 PCDH15Q96QU1 1955 aa23.24■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa23.24■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 ANTXRLA6NF34 631 aa23.24■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 GREM1O60565 184 aa23.24■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 KAT7O95251 611 aa23.24■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 APODP05090 189 aa23.24■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 SLC6A11P48066 632 aa23.24■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 MXI1P50539 228 aa23.24■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 LY6G5CQ5SRR4 150 aa23.24■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 PIP4P1Q86T03 277 aa23.24■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 SFTPA1Q8IWL2 248 aa23.24■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 BBS7Q8IWZ6 715 aa23.24■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 TMEFF1Q8IYR6 380 aa23.24■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 CCDC150Q8NCX0 1101 aa23.24■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 SPATA20Q8TB22 786 aa23.24■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 WBP2Q969T9 261 aa23.24■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 MMRN2Q9H8L6 949 aa23.24■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 TMEM74BQ9NUR3 256 aa23.24■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 KLK13Q9UKR3 277 aa23.24■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 PCNX2A6NKB5 2137 aa23.24■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 H0Y626 953 aa23.23■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 SGK1O00141 431 aa23.23■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 CYP26A1O43174 497 aa23.23■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 TRIM16O95361 564 aa23.23■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 EPB41P11171 864 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 TIE1P35590 1138 aa23.23■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 GRIA2P42262 883 aa23.23■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 GAD2Q05329 585 aa23.23■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 RING1Q06587 406 aa23.23■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 SEMA3BQ13214 749 aa23.23■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 MAP7D1Q3KQU3 841 aa23.23■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 KLHDC10Q6PID8 442 aa23.23■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 LRSAM1Q6UWE0 723 aa23.23■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 HDDC3Q8N4P3 179 aa23.23■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 TTC39CQ8N584 583 aa23.23■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 FBXL13Q8NEE6 735 aa23.23■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 ENGASEQ8NFI3 743 aa23.23■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 HMGB4Q8WW32 186 aa23.23■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 SEMA4DQ92854 862 aa23.23■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 GSDMAQ96QA5 445 aa23.23■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 OSER1Q9NX31 292 aa23.23■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 PILRBQ9UKJ0 227 aa23.23■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa23.23■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 CD58P19256 250 aa23.22■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 RDXP35241 583 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 PRCPP42785 496 aa23.22■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 KIF11P52732 1056 aa23.22■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 HTR3DQ70Z44 454 aa23.22■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 RABEPKQ7Z6M1 372 aa23.22■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 DNAI2Q9GZS0 605 aa23.22■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 NACA2Q9H009 215 aa23.22■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 ARHGEF4Q9NR80 690 aa23.22■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 AKAP13Q12802 2813 aa23.21■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa23.21■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa23.21■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 CETN3O15182 167 aa23.21■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 AP5Z1O43299 807 aa23.21■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 STX10O60499 249 aa23.21■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 CFIP05156 583 aa23.21■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 ACO1P21399 889 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 CCDC186Q7Z3E2 898 aa23.21■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 ZNF276Q8N554 614 aa23.21■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 FRMD1Q8N878 549 aa23.21■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 CEP76Q8TAP6 659 aa23.21■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 EEF2KMTQ96G04 330 aa23.21■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 DUSP16Q9BY84 665 aa23.21■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 NMUR1Q9HB89 426 aa23.21■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 SPHK2Q9NRA0 654 aa23.21■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 RAB20Q9NX57 234 aa23.21■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 USP3Q9Y6I4 520 aa23.21■■□□□ 1.31
SRRT-218ENST00000620394 CACNA1EQ15878 2313 aa23.21■■□□□ 1.31
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