RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 WDR72Q3MJ13 1102 aa22.54■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 ADGRF2Q8IZF7 708 aa22.54■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 MAIP1Q8WWC4 291 aa22.54■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 RTP3Q9BQQ7 232 aa22.54■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 ADAM22Q9P0K1 906 aa22.54■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 THAP12O43422 761 aa22.53■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 MAN1A1P33908 653 aa22.53■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 MYL6P60660 151 aa22.53■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 SOWAHAQ2M3V2 549 aa22.53■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 EMC10Q5UCC4 262 aa22.53■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 CPNE8Q86YQ8 564 aa22.53■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF606Q8WXB4 792 aa22.53■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 SLCO2A1Q92959 643 aa22.53■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 CORO1BQ9BR76 489 aa22.53■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.53■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 FAM129AQ9BZQ8 928 aa22.53■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa22.53■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 MTMR11A4FU01 709 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 POU2F2P09086 479 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 ATICP31939 592 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 HSD17B3P37058 310 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 SMARCB1Q12824 385 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 TTMPQ5BVD1 217 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 ZBTB9Q96C00 473 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 ACBD6Q9BR61 282 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 TRIM51Q9BSJ1 452 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 XYLT2Q9H1B5 865 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 LRRC19Q9H756 370 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 RHOP08100 348 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 CFHP08603 1231 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 MMP8P22894 467 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 ACTN2P35609 894 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 TUFMP49411 452 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 EPHB3P54753 998 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 PLD1Q13393 1074 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 MAMLD1Q13495 774 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 MGAT5BQ3V5L5 792 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 TMC3Q7Z5M5 1100 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 LRRTM3Q86VH5 581 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 SPATA18Q8TC71 538 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 ARL8AQ96BM9 186 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 TXLNGYQ9BZA5 131 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 CISHQ9NSE2 258 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 PARVAQ9NVD7 372 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 PCDHGC3Q9UN70 934 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 FAM86C2PA6NEL3 165 aa22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 A6NNZ2 444 aa22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 PSTPIP1O43586 416 aa22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 PCSK1P29120 753 aa22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 COILP38432 576 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 TUBB8Q3ZCM7 444 aa22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 CYP4A22Q5TCH4 519 aa22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 C18orf8Q96DM3 657 aa22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 MYADMQ96S97 322 aa22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 C11orf70Q9BRQ4 267 aa22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 PLAAQ9Y263 795 aa22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 YIPF1Q9Y548 306 aa22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 NFS1Q9Y697 457 aa22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 MYO10Q9HD67 2058 aa22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 PPFIA2O75334 1257 aa22.5■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 VNN2O95498 520 aa22.5■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 ASGR2P07307 311 aa22.5■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 RARAP10276 462 aa22.5■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 SKOR1P84550 965 aa22.5■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF699Q32M78 642 aa22.5■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 TTC27Q6P3X3 843 aa22.5■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 SPPL2BQ8TCT7 592 aa22.5■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 FMO2Q99518 471 aa22.5■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 TRIM7Q9C029 511 aa22.5■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 DPH5Q9H2P9 285 aa22.5■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 CRISPLD1Q9H336 500 aa22.5■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 SNX25Q9H3E2 840 aa22.5■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa22.5■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 DOCK6Q96HP0 2047 aa22.5■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 GABRDO14764 452 aa22.49■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 CALB1P05937 261 aa22.49■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 PDGFRBP09619 1106 aa22.49■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 LAMP2P13473 410 aa22.49■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 ASPAP45381 313 aa22.49■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.49■■□□□ 1.19
SGMS1-210ENST00000619438 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
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