RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	ZACN	Q401N2	412 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	CHPF	Q8IZ52	775 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	BHMT	Q93088	406 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC32A1	Q9H598	525 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	NMUR1	Q9HB89	426 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	12.61	□□□□□ -0.39	6e-7	■■■■■ 62.1
TTLL3-233	ENST00000602338	DMAC2	Q9NW81	257 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	COMMD8	Q9NX08	183 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	12.6	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		12.6	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	WASH3P	C4AMC7	463 aa		12.6	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	12.6	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	12.6	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	CD59	P13987	128 aa		12.6	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	ADORA2B	P29275	332 aa		12.6	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	RESP18	Q5W5W9	173 aa		12.6	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		12.6	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338		Q6ZNB5	142 aa		12.6	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		12.6	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		12.6	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	CEP76	Q8TAP6	659 aa		12.6	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		12.6	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		12.6	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		12.6	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		12.6	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	12.6	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	PLK2	Q9NYY3	685 aa		12.6	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	SCML2	Q9UQR0	700 aa		12.6	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		12.6	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		12.59	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1W2PQH9	124 aa		12.59	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGAP33	O14559	1287 aa		12.59	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	OPHN1	O60890	802 aa		12.59	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	GJB3	O75712	270 aa		12.59	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	CISD3	P0C7P0	127 aa		12.59	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM200B	P0CF97	657 aa		12.59	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	AP3M2	P53677	418 aa		12.59	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	12.59	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	INCA1	Q0VD86	236 aa		12.59	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	12.59	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	SV2A	Q7L0J3	742 aa		12.59	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		12.59	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		12.59	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		12.59	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	12.59	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	12.59	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	12.59	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	12.59	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		12.59	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	PTPRB	P23467	1997 aa		12.59	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1W2PQD8	194 aa		12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF217	O75362	1048 aa		12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	HLA-DRA	P01903	254 aa		12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	KLKB1	P03952	638 aa		12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	NR3C1	P04150	777 aa		12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	RARG	P13631	454 aa		12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	PIK3CA	P42336	1068 aa		12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	DGKG	P49619	791 aa		12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	SCD5	Q86SK9	330 aa		12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	UNC93A	Q86WB7	457 aa		12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM131	Q92545	1883 aa		12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	BACH2	Q9BYV9	841 aa		12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	NUMA1	Q14980	2115 aa		12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	TAF4	O00268	1085 aa		12.57	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	SH3BP5	O60239	455 aa		12.57	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	STC2	O76061	302 aa		12.57	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	CAPNS1	P04632	268 aa		12.57	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	P4HA1	P13674	534 aa		12.57	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	MAOB	P27338	520 aa		12.57	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	ME1	P48163	572 aa		12.57	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	RING1	Q06587	406 aa		12.57	□□□□□ -0.4

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