RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 ATF2P15336 505 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TCF4P15884 667 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 IGFBP4P22692 258 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ANXA13P27216 316 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 GJC1P36383 396 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 FLT3P36888 993 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 NOP2P46087 812 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 PLA2G4AP47712 749 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 DNA2P51530 1060 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CLCN4P51793 760 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 DAOAP59103 153 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 HYAL1Q12794 435 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MAMLD1Q13495 774 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ARTNQ5T4W7 220 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAJC24Q6P3W2 148 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 LILRA6Q6PI73 481 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 OLFML1Q6UWY5 402 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 EP400NLQ6ZTU2 488 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SCD5Q86SK9 330 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CD163Q86VB7 1156 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC35G2Q8TBE7 412 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ADAM32Q8TC27 787 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SPPL2BQ8TCT7 592 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 PPM1EQ8WY54 764 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MYLIPQ8WY64 445 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 C18orf8Q96DM3 657 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MCRS1Q96EZ8 462 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SAMD11Q96NU1 681 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MCEEQ96PE7 176 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MAGEB5Q9BZ81 275 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TLE6Q9H808 572 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MAN1C1Q9NR34 630 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 OSER1Q9NX31 292 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 FNIP2Q9P278 1114 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 FBXW11Q9UKB1 542 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 LZTS1Q9Y250 596 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 USTQ9Y2C2 406 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CEP83Q9Y592 693 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 GRID2IPA4D2P6 1211 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD62A6NC57 917 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 PJA2O43164 708 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 NRDCO43847 1150 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 GLP2RO95838 553 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TBX18O95935 607 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 FTCDO95954 541 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 GLUD1P00367 558 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP1A2P05177 515 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 FYNP06241 537 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM253P0C7T8 217 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 GZMAP12544 262 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MYL4P12829 197 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ELF1P32519 619 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CCR2P41597 374 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MAGEA11P43364 429 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MARCKSL1P49006 195 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 RPL34P49207 117 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TAS2R40P59535 323 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 GPC5P78333 572 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 KRT83P78385 493 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP4F8P98187 520 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP11AP98196 1134 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 UBE3AQ05086 875 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TAF10Q12962 218 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MESDQ14696 234 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 STILQ15468 1287 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CLUL1Q15846 466 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 DUSP6Q16828 381 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CDO1Q16878 200 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 LRIT3Q3SXY7 679 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CFAP221Q4G0U5 840 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB41Q5JT25 222 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 PPM1LQ5SGD2 360 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 STXBP5Q5T5C0 1151 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 LIN9Q5TKA1 542 aa6.32□□□□□ -1.4
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