RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 C16orf59Q7L2K0 433 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 HDXQ7Z353 690 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 NUP93Q8N1F7 819 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 SCAMP5Q8TAC9 235 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC35B2Q8TB61 432 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 IFT81Q8WYA0 676 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 NTAN1Q96AB6 310 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 SPATA17Q96L03 361 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 CEP295NLQ96MC4 621 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM129AQ9BZQ8 928 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 SCML2Q9UQR0 700 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 NEU2Q9Y3R4 380 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 PLXNA3P51805 1871 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM92AA1XBS5 289 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 DAPK3O43293 454 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 SOD2P04179 222 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 DEUP1Q05D60 604 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 OASLQ15646 514 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 RFX6Q8HWS3 928 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 SCN4BQ8IWT1 228 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC185Q8N715 623 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 CALN1Q9BXU9 219 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 FBXO44Q9H4M3 255 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 MTMR10Q9NXD2 777 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 NFU1Q9UMS0 254 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 AP4E1Q9UPM8 1137 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 ALPK3Q96L96 1907 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 GAS8O95995 478 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 IGLV3-25P01717 112 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 APOC2P02655 101 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 NCAM1P13591 858 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 CPB1P15086 417 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 VCPP55072 806 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 SCAPQ12770 1279 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC9A4Q6AI14 798 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 GPR65Q8IYL9 337 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 ATAD1Q8NBU5 361 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 FBXO22Q8NEZ5 403 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC7A14Q8TBB6 771 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 ABCC13Q9NSE7 274 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 SPG21Q9NZD8 308 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 PTPRSQ13332 1948 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 FGBP02675 491 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 ITGAVP06756 1048 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 CXCR3P49682 368 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 DSG1Q02413 1049 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT17Q04695 432 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 MMRN1Q13201 1228 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 PSMD5Q16401 504 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 SCD5Q86SK9 330 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGAP18Q8N392 663 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 PQLC3Q8N755 202 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 PGLYRP2Q96PD5 576 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 PIGVQ9NUD9 493 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM53CQ9NYF3 392 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 HSFX1Q9UBD0 423 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 FBXW11Q9UKB1 542 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 DNPEPQ9ULA0 475 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 TGM2P21980 687 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 FPGSQ05932 587 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 CASP8Q14790 479 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP1R7Q15435 360 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 DDR2Q16832 855 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 MON1AQ86VX9 555 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM131BQ86XD5 332 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 MREGQ8N565 214 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 ALLCQ8N6M5 410 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 PCDH19Q8TAB3 1148 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 ACTL9Q8TC94 416 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM169Q96HH4 297 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 DPH5Q9H2P9 285 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 VIPAS39Q9H9C1 493 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 GRHL1Q9NZI5 618 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 STK39Q9UEW8 545 aa23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms