RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581080.1

RARA-AS1-201, RARA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARA-AS1, Length 1,790 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARA-AS1-201ENST00000581080 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 LPXNO60711 386 aa24.38■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 FGGP02679 453 aa24.38■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 IRS1P35568 1242 aa24.38■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 TWF1Q12792 350 aa24.38■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 NME3Q13232 169 aa24.38■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 CLUL1Q15846 466 aa24.38■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 RAPGEF5Q92565 580 aa24.38■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 MYRFLQ96LU7 910 aa24.38■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLITRK1Q96PX8 696 aa24.38■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 KLHL11Q9NVR0 708 aa24.38■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 FBXW11Q9UKB1 542 aa24.38■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 F9P00740 461 aa24.37■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 KRT1P04264 644 aa24.37■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 DEUP1Q05D60 604 aa24.37■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 VEPH1Q14D04 833 aa24.37■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 ADAM32Q8TC27 787 aa24.37■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 TEKT4Q8WW24 435 aa24.37■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa24.37■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa24.37■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 PIGVQ9NUD9 493 aa24.37■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 CLIC5Q9NZA1 410 aa24.37■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 CHD7Q9P2D1 2997 aa24.37■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 GLUD1P00367 558 aa24.37■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa24.37■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 EPHB3P54753 998 aa24.37■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 ITIH3Q06033 890 aa24.37■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 ODF2Q5BJF6 829 aa24.37■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCDC50Q8IVM0 306 aa24.37■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 SPATA4Q8NEY3 305 aa24.37■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 CERS4Q9HA82 394 aa24.37■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 DDIT4Q9NX09 232 aa24.37■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa24.36■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 LRRD1A4D1F6 860 aa24.36■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 MDM4O15151 490 aa24.36■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 CLCN4P51793 760 aa24.36■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 LONRF2Q1L5Z9 754 aa24.36■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 ERMARDQ5T6L9 678 aa24.36■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 PPP2R2DQ66LE6 453 aa24.36■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCDC149Q6ZUS6 474 aa24.36■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM131BQ86XD5 332 aa24.36■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 TDHQ8IZJ6 230 aa24.36■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 RNF139Q8WU17 664 aa24.36■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 HSPH1Q92598 858 aa24.36■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 COX16Q9P0S2 106 aa24.36■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 PI4K2BG5E9Z4 385 aa24.35■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 IGLV3-25P01717 112 aa24.35■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 COPS2P61201 443 aa24.35■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 PLD1Q13393 1074 aa24.35■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 TAC4Q86UU9 113 aa24.35■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 KCTD6Q8NC69 237 aa24.35■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 KREMEN2Q8NCW0 462 aa24.35■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 MYRIPQ8NFW9 859 aa24.35■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 OVCA2Q8WZ82 227 aa24.35■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 PSMG2Q969U7 264 aa24.35■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 SMOC2Q9H3U7 446 aa24.35■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM204AQ9H8W3 233 aa24.35■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC28A3Q9HAS3 691 aa24.35■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP24.35■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP24.35■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 CHD9Q3L8U1 2897 aa24.34■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 C1RP00736 705 aa24.34■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 KDELR1P24390 212 aa24.34■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 CETN2P41208 172 aa24.34■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 TAF12Q16514 161 aa24.34■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 MFSD7Q6UXD7 560 aa24.34■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa24.34■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCDC185Q8N715 623 aa24.34■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 PDZD8Q8NEN9 1154 aa24.34■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP24.34■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 NUDT5Q9UKK9 219 aa24.34■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 EFCAB8A8MWE9 144 aa24.34■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 C8AP07357 584 aa24.34■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 RALAP11233 206 aa24.34■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 RARGP13631 454 aa24.34■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 GBP1P32455 592 aa24.34■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 LLGL1Q15334 1064 aa24.34■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 TFDP3Q5H9I0 405 aa24.34■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 SNX30Q5VWJ9 437 aa24.34■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 MSANTD2Q6P1R3 559 aa24.34■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa24.34■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 CASP10Q92851 521 aa24.34■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 OSBPL8Q9BZF1 889 aa24.34■■□□□ 1.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 MYO7AQ13402 2215 aa24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms