RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568530.5

PDPR-210, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 7,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-210ENST00000568530 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TUBB6Q9BUF5 446 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 SH3D21A4FU49 640 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 VPS26AO75436 327 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 RAP1GAPP47736 663 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
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PDPR-210ENST00000568530 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ENO4A6NNW6 628 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 FAM200BP0CF97 657 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 MYL2P10916 166 aa8.69□□□□□ -1.02
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PDPR-210ENST00000568530 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ITIH5Q86UX2 942 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 PROM2Q8N271 834 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 CCDC54Q8NEL0 328 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 CYP4F12Q9HCS2 524 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 DMTF1Q9Y222 760 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 EFR3BQ9Y2G0 817 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 PDGFRAP16234 1089 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
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PDPR-210ENST00000568530 KCNN2Q9H2S1 579 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 CHMP2BQ9UQN3 213 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 OR6B1O95007 311 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ITGB3P05106 788 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 NUDT17P0C025 328 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 CASP4P49662 377 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 INPP5AQ14642 412 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 KCTD8Q6ZWB6 473 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 P4HA3Q7Z4N8 544 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 P3H2Q8IVL5 708 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 PRSS58Q8IYP2 241 aa8.69□□□□□ -1.02
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PDPR-210ENST00000568530 CXorf40BQ96DE9 158 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 RADILQ96JH8 1075 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 C9orf72Q96LT7 481 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 CDADC1Q9BWV3 514 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 FZD1Q9UP38 647 aa8.69□□□□□ -1.02
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PDPR-210ENST00000568530 CTDNEP1O95476 244 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 CD4P01730 458 aa8.68□□□□□ -1.02
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PDPR-210ENST00000568530 DUX4L6P0CJ89 424 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 DUX4L7P0CJ90 424 aa8.68□□□□□ -1.02
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PDPR-210ENST00000568530 MMRN1Q13201 1228 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ALG11Q2TAA5 492 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ATF7IP2Q5U623 682 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ZNF544Q6NX49 715 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 SEC16BQ96JE7 1060 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TRABDQ9H4I3 376 aa8.68□□□□□ -1.02
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PDPR-210ENST00000568530 DUX4Q9UBX2 424 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 FAM25EA8MYX2 175 aa8.68□□□□□ -1.02
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PDPR-210ENST00000568530 CCDC103Q8IW40 242 aa8.68□□□□□ -1.02
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PDPR-210ENST00000568530 M0QYT0 321 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 PLGP00747 810 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 DBIP07108 87 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 NTSP30990 170 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 SOX6P35712 828 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 GDI2P50395 445 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
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PDPR-210ENST00000568530 PLEKHH3Q7Z736 793 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 OR8H2Q8N162 312 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ZIM3Q96PE6 472 aa8.68□□□□□ -1.02
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