RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565236.1

CLN3-215, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 3

Gene CLN3, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-215ENST00000565236 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 HESX1Q9UBX0 185 aa23.62■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 INVSQ9Y283 1065 aa23.62■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 BICDL2A1A5D9 508 aa23.61■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa23.61■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa23.61■■□□□ 1.37
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CLN3-215ENST00000565236 CD19P15391 556 aa23.61■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 GBP1P32455 592 aa23.61■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 COG7P83436 770 aa23.61■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa23.61■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 RAB41Q5JT25 222 aa23.61■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 GRAMD4Q6IC98 578 aa23.61■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 RASSF3Q86WH2 238 aa23.61■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 KCNV2Q8TDN2 545 aa23.61■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 NELFBQ8WX92 580 aa23.61■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
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CLN3-215ENST00000565236 STC2O76061 302 aa23.6■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 ZNF806P0C7X5 589 aa23.6■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 TYRP14679 529 aa23.6■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 BMP6P22004 513 aa23.6■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 TKTL1P51854 596 aa23.6■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 BCAT1P54687 386 aa23.6■■□□□ 1.37
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CLN3-215ENST00000565236 EFEMP1Q12805 493 aa23.6■■□□□ 1.37
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CLN3-215ENST00000565236 C10orf76Q5T2E6 689 aa23.6■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 TTI2Q6NXR4 508 aa23.6■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 C11orf74Q86VG3 221 aa23.6■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 TERB1Q8NA31 727 aa23.6■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa23.6■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 RASAL2Q9UJF2 1139 aa23.6■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 TSPAN16Q9UKR8 245 aa23.6■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 KIAA1257Q9ULG3 409 aa23.6■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 TRIM24O15164 1050 aa23.59■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 PMM2O15305 246 aa23.59■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 ZBED1O96006 694 aa23.59■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
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CLN3-215ENST00000565236 PDE4CQ08493 712 aa23.59■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
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CLN3-215ENST00000565236 Q6ZNB5 142 aa23.59■■□□□ 1.37
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CLN3-215ENST00000565236 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 MDGA1Q8NFP4 955 aa23.59■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 NT5C1BQ96P26 610 aa23.59■■□□□ 1.37
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CLN3-215ENST00000565236 MARCH2Q9P0N8 246 aa23.58■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP23.58■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 STRIP2Q9ULQ0 834 aa23.58■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 CTNND2Q9UQB3 1225 aa23.58■■□□□ 1.37
CLN3-215ENST00000565236 ABCA7Q8IZY2 2146 aa23.57■■□□□ 1.36
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CLN3-215ENST00000565236 MPLP40238 635 aa23.57■■□□□ 1.36
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CLN3-215ENST00000565236 CHKAP35790 457 aa23.56■■□□□ 1.36
CLN3-215ENST00000565236 CREB5Q02930 508 aa23.56■■□□□ 1.36
CLN3-215ENST00000565236 PAK1Q13153 545 aa23.56■■□□□ 1.36
CLN3-215ENST00000565236 PLA2G2CQ5R387 149 aa23.56■■□□□ 1.36
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