RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558963.2

AC087516.2-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC087516.2, Length 3,042 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC087516.2-201ENST00000558963 ARHGAP18Q8N392 663 aa6.7□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 PLD5Q8N7P1 536 aa6.7□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 RNF149Q8NC42 400 aa6.7□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 TCP10LQ8TDR4 215 aa6.7□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 TSSK1BQ9BXA7 367 aa6.7□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 KLC2Q9H0B6 622 aa6.7□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 PLAC1Q9HBJ0 212 aa6.7□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 ERAP1Q9NZ08 941 aa6.7□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.7□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 MORF4L1Q9UBU8 362 aa6.7□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa6.7□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 PLLPQ9Y342 182 aa6.7□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 USP3Q9Y6I4 520 aa6.7□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 NUMBLQ9Y6R0 609 aa6.7□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 ASB14A6NK59 587 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 ETS1P14921 441 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 FDFT1P37268 417 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 TUBP50607 506 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 RBP5P82980 135 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 PTK7Q13308 1070 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 XKR4Q5GH76 650 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 ATG16L1Q676U5 607 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 STRADAQ7RTN6 431 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 C4orf33Q8N1A6 199 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 PQLC3Q8N755 202 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 KCTD6Q8NC69 237 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 SPATA18Q8TC71 538 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 NRG4Q8WWG1 115 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 TTC17Q96AE7 1141 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 DNAI2Q9GZS0 605 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 GPAMQ9HCL2 828 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 VTA1Q9NP79 307 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 SCOCQ9UIL1 159 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 APOL1O14791 398 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 LPXNO60711 386 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 DGKIO75912 1065 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 APOEP02649 317 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 MT-ND3P03897 115 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 ADRA1DP25100 572 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 ACADSBP45954 432 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 VPS41P49754 854 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 PPIL2Q13356 520 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 LAMC2Q13753 1193 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 SLC5A9Q2M3M2 681 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 C2CD6Q53TS8 623 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 KAZNQ674X7 775 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 TRNP1Q6NT89 227 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 RFWD3Q6PCD5 774 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 DSTYKQ6XUX3 929 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 ZNF534Q76KX8 674 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 LRRC6Q86X45 466 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 PALM2Q8IXS6 379 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 OR6Y1Q8NGX8 325 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 PPTC7Q8NI37 304 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 GSDMBQ8TAX9 411 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 SLC35F5Q8WV83 523 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 ADPGKQ9BRR6 497 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 NPHS2Q9NP85 383 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 ARL8BQ9NVJ2 186 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 ADAM28Q9UKQ2 775 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 ENO4A6NNW6 628 aa6.68□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 LACTBL1A8MY62 500 aa6.68□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 GPR25O00155 361 aa6.68□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 SMIM24O75264 130 aa6.68□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 RFPL1O75677 317 aa6.68□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 KRT38O76015 456 aa6.68□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 ARIH2O95376 493 aa6.68□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 INHBAP08476 426 aa6.68□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 NFICP08651 508 aa6.68□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 STAG3L1P0CL83 205 aa6.68□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 GNAT1P11488 350 aa6.68□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 AOC1P19801 751 aa6.68□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 PRDX6P30041 224 aa6.68□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 SSTR1P30872 391 aa6.68□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 ELK3P41970 407 aa6.68□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 SERPINB4P48594 390 aa6.68□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 RGS19P49795 217 aa6.68□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 CSRP3P50461 194 aa6.68□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 ARFIP2P53365 341 aa6.68□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 SLC6A3Q01959 620 aa6.68□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 BTKQ06187 659 aa6.68□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 NIPAL4Q0D2K0 466 aa6.68□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 CCDC14Q49A88 953 aa6.68□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 CYP4A22Q5TCH4 519 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms