RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557640.1

RD3L-201, Transcript of retinal degeneration 3 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene RD3L, Length 1,201 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3L-201ENST00000557640 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 WBP2Q969T9 261 aa8.49□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 ERLEC1Q96DZ1 483 aa8.49□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 HSH2DQ96JZ2 352 aa8.49□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 TIPINQ9BVW5 301 aa8.49□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa8.49□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 TRIM9Q9C026 710 aa8.49□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 CD248Q9HCU0 757 aa8.49□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 DPP3Q9NY33 737 aa8.49□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 PILRBQ9UKJ0 227 aa8.49□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa8.49□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 C2CD2Q9Y426 696 aa8.49□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 RNF114Q9Y508 228 aa8.49□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 SHROOM3Q8TF72 1996 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 FAM221BA6H8Z2 402 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 KPNA7A9QM74 516 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 LEFTY2O00292 366 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 TNFRSF10BO14763 440 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 TRIM24O15164 1050 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 XPOTO43592 962 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 GJB3O75712 270 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 USP17L7P0C7H9 530 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 CSH1P0DML2 217 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 CSH2P0DML3 217 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 TCF3P15923 654 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 KCNA1Q09470 495 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 SCAPQ12770 1279 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 TAF12Q16514 161 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 SLC23A3Q6PIS1 610 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 PDZD3Q86UT5 571 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 SYT12Q8IV01 421 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 PNPLA1Q8N8W4 532 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 HMGB4Q8WW32 186 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 SLC6A17Q9H1V8 727 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 CRTAC1Q9NQ79 661 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 ZNF358Q9NW07 568 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 SIX4Q9UIU6 781 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 GTF3C4Q9UKN8 822 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 DSEQ9UL01 958 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 DERAQ9Y315 318 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 STYXL1Q9Y6J8 313 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 PLXNA2O75051 1894 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 ATMQ13315 3056 aa8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 VWA3AA6NCI4 1184 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 CYSRT1A8MQ03 144 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 UPK3BL1B0FP48 263 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 UPK3BL2E5RIL1 263 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 OLFM2O95897 454 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 ITGB3P05106 788 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 CFIP05156 583 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 GABRG2P18507 467 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 PLCG1P19174 1290 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 FSTP19883 344 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 GTF2BQ00403 316 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 MCM6Q14566 821 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 DHCR24Q15392 516 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 SV2CQ496J9 727 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 LYSMD4Q5XG99 296 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 MINDY1Q8N5J2 469 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 MDM1Q8TC05 714 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 MYLPFQ96A32 169 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 SAAL1Q96ER3 474 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 P2RY11Q96G91 374 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 MEGF10Q96KG7 1140 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 RNF38Q9H0F5 515 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 ASB7Q9H672 318 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 ABCB6Q9NP58 842 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 SMPD4Q9NXE4 827 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 ZMYM5Q9UJ78 669 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 ODF2LQ9ULJ1 636 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 KNL1Q8NG31 2342 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 MAST4O15021 2626 aa8.47□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 MYLKQ15746 1914 aa8.46□□□□□ -1.05
RD3L-201ENST00000557640 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa8.46□□□□□ -1.06
RD3L-201ENST00000557640 A0A1W2PQF6 199 aa8.46□□□□□ -1.06
RD3L-201ENST00000557640 GABRDO14764 452 aa8.46□□□□□ -1.06
RD3L-201ENST00000557640 SH3BP5O60239 455 aa8.46□□□□□ -1.06
RD3L-201ENST00000557640 KAT7O95251 611 aa8.46□□□□□ -1.06
RD3L-201ENST00000557640 NFATC1O95644 943 aa8.46□□□□□ -1.06
RD3L-201ENST00000557640 OAS1P00973 400 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
RD3L-201ENST00000557640 LMO2P25791 158 aa8.46□□□□□ -1.06
RD3L-201ENST00000557640 WASP42768 502 aa8.46□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms