RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553948.1

TTC7B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, humanhuman

TSL 5

Gene TTC7B, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7B-202ENST00000553948 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 BICDL2A1A5D9 508 aa33.94■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa33.94■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa33.94■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 SGK1O00141 431 aa33.94■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 DCLK1O15075 740 aa33.94■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 ALDH1A2O94788 518 aa33.94■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 CD19P15391 556 aa33.94■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 MORC3Q14149 939 aa33.94■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 FOXR2Q6PJQ5 311 aa33.94■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 TMEM92Q6UXU6 159 aa33.94■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 RTKNQ9BST9 563 aa33.94■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 TSPAN16Q9UKR8 245 aa33.94■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa33.94■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 BIN1O00499 593 aa33.93■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 PMM2O15305 246 aa33.93■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 STC2O76061 302 aa33.93■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 RHOBTB1O94844 696 aa33.93■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 BCAT1P54687 386 aa33.93■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 GRAMD4Q6IC98 578 aa33.93■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 Q6ZNB5 142 aa33.93■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 TPGS1Q6ZTW0 290 aa33.93■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 TERB1Q8NA31 727 aa33.93■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 KCNV2Q8TDN2 545 aa33.93■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP33.93■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 MARK1Q9P0L2 795 aa33.93■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 HESX1Q9UBX0 185 aa33.93■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 RASAL2Q9UJF2 1139 aa33.93■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 CTNND2Q9UQB3 1225 aa33.93■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 CACNG3O60359 315 aa33.92■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 TYRP14679 529 aa33.92■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP33.92■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 GBP1P32455 592 aa33.92■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 TKTL1P51854 596 aa33.92■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 COG7P83436 770 aa33.92■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 CCDC6Q16204 474 aa33.92■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 C10orf76Q5T2E6 689 aa33.92■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 C11orf74Q86VG3 221 aa33.92■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 UBR7Q8N806 425 aa33.92■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 MDGA1Q8NFP4 955 aa33.92■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 NT5C1BQ96P26 610 aa33.92■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa33.92■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 KIAA1257Q9ULG3 409 aa33.92■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 INVSQ9Y283 1065 aa33.92■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 ZBED1O96006 694 aa33.91■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 ZNF806P0C7X5 589 aa33.91■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 VDRP11473 427 aa33.91■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP33.91■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 PDE4CQ08493 712 aa33.91■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 BST2Q10589 180 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 CETN1Q12798 172 aa33.91■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 EFEMP1Q12805 493 aa33.91■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 ZNF510Q9Y2H8 683 aa33.91■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 DNAH14Q0VDD8 3507 aa33.91■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 TRIM24O15164 1050 aa33.9■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 LRRC4Q9HBW1 653 aa33.9■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 TULP2O00295 520 aa33.89■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 GDF9O60383 454 aa33.89■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 ADAM23O75077 832 aa33.89■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 MPLP40238 635 aa33.89■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP33.89■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 PM20D1Q6GTS8 502 aa33.89■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 ULBP1Q9BZM6 244 aa33.89■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 DCLK3Q9C098 648 aa33.89■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 MARCH2Q9P0N8 246 aa33.89■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 STRIP2Q9ULQ0 834 aa33.89■■■■□ 3.02
TTC7B-202ENST00000553948 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
TTC7B-202ENST00000553948 SLC30A4O14863 429 aa33.88■■■■□ 3.01
TTC7B-202ENST00000553948 P4HA2O15460 535 aa33.88■■■■□ 3.01
TTC7B-202ENST00000553948 HMBSP08397 361 aa33.88■■■■□ 3.01
TTC7B-202ENST00000553948 PAK1Q13153 545 aa33.88■■■■□ 3.01
TTC7B-202ENST00000553948 PLA2G2CQ5R387 149 aa33.88■■■■□ 3.01
TTC7B-202ENST00000553948 TMEM270Q6UE05 265 aa33.88■■■■□ 3.01
TTC7B-202ENST00000553948 PPM1KQ8N3J5 372 aa33.88■■■■□ 3.01
TTC7B-202ENST00000553948 UBA3Q8TBC4 463 aa33.88■■■■□ 3.01
TTC7B-202ENST00000553948 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP33.88■■■■□ 3.01
TTC7B-202ENST00000553948 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa33.88■■■■□ 3.01
TTC7B-202ENST00000553948 DCDC2BA2VCK2 349 aa33.87■■■■□ 3.01
TTC7B-202ENST00000553948 O00370 1275 aa33.87■■■■□ 3.01
TTC7B-202ENST00000553948 GNA14O95837 355 aa33.87■■■■□ 3.01
TTC7B-202ENST00000553948 KLKB1P03952 638 aa33.87■■■■□ 3.01
TTC7B-202ENST00000553948 PAEPP09466 180 aa33.87■■■■□ 3.01
TTC7B-202ENST00000553948 SETSIPP0DME0 302 aa33.87■■■■□ 3.01
TTC7B-202ENST00000553948 STX17P56962 302 aa33.87■■■■□ 3.01
TTC7B-202ENST00000553948 BHMTQ93088 406 aa33.87■■■■□ 3.01
TTC7B-202ENST00000553948 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP33.87■■■■□ 3.01
TTC7B-202ENST00000553948 STARD13Q9Y3M8 1113 aa33.87■■■■□ 3.01
TTC7B-202ENST00000553948 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
TTC7B-202ENST00000553948 ADIGQ0VDE8 80 aa33.86■■■■□ 3.01
TTC7B-202ENST00000553948 OLIG1Q8TAK6 271 aa33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms