RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	CEP76	Q8TAP6	659 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	CXorf38	Q8TB03	319 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	ZNF516	Q92618	1163 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	PNKP	Q96T60	521 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	DPP3	Q9NY33	737 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	RAD54B	Q9Y620	910 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	IKBKB	O14920	756 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	NFATC1	O95644	943 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	CSH1	P0DML2	217 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	CSH2	P0DML3	217 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	KRT13	P13646	458 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	TNNI1	P19237	187 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	EOGT	Q5NDL2	527 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	METTL23	Q86XA0	190 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	EXOC4	Q96A65	974 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222		A0A1W2PQF6	199 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	ATP2C2	O75185	946 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	GNA14	O95837	355 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	TNNC2	P02585	160 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	APOD	P05090	189 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	NDUFV2	P19404	249 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	AP3M2	P53677	418 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	MYO1E	Q12965	1108 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	WBP2	Q969T9	261 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	PKMYT1	Q99640	499 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	SIX4	Q9UIU6	781 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	KCNK3	O14649	394 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	ITGB3	P05106	788 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	SYP	P08247	313 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	TRIM49	P0CI25	452 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	TRIM49C	P0CI26	452 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	GTF2H1	P32780	548 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	ABCG1	P45844	678 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	PPP3CA	Q08209	521 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	SPATA18	Q8TC71	538 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	MYRFL	Q96LU7	910 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	THAP9	Q9H5L6	903 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	PRORY	Q9H606	182 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	14.62	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	CPQ	Q9Y646	472 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	WASH3P	C4AMC7	463 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	PLK4	O00444	970 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	ABL1	P00519	1130 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	HOXB2	P14652	356 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	PAX3	P23760	479 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	HOXD12	P35452	270 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	TAF6	P49848	677 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	RBP5	P82980	135 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	ZACN	Q401N2	412 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		14.61	□□□□□ -0.07

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