RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 KSR1Q8IVT5 923 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 RFKQ969G6 155 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SGK3Q96BR1 496 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF558Q96NG5 402 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 IFT22Q9H7X7 185 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PLA2G6O60733 806 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGEF15O94989 841 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 GSNP06396 782 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MDH1P40925 334 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SLCO1A2P46721 670 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 NPTX2P47972 431 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 DNA2P51530 1060 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 GALK1P51570 392 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MORC3Q14149 939 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CLCA4Q14CN2 919 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 KLHL38Q2WGJ6 581 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MMEL1Q495T6 779 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MIB1Q86YT6 1006 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 C10orf53Q8N6V4 93 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 OR8K3Q8NH51 312 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TEX47Q8TBZ9 253 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SEC16BQ96JE7 1060 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 DACH2Q96NX9 599 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MED15Q96RN5 788 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 FBXO28Q9NVF7 368 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ARMC1Q9NVT9 282 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ASNSD1Q9NWL6 643 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SLC39A1Q9NY26 324 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SPASTQ9UBP0 616 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 IFT172Q9UG01 1749 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PDPK1O15530 556 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 H2AFZP0C0S5 128 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ATP6V1C1P21283 382 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ADCY8P40145 1251 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ME3Q16798 604 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TSGA10IPQ3SY00 556 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 HES5Q5TA89 166 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 C1orf146Q5VVC0 180 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SLC2A7Q6PXP3 512 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 H2AFVQ71UI9 128 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 KRT77Q7Z794 578 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 DENND6AQ8IWF6 608 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 RAD54LQ92698 747 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 RNPEPQ9H4A4 650 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 HAUS4Q9H6D7 363 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ZMYM5Q9UJ78 669 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 BTBD19C9JJ37 291 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 LAG3P18627 525 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PAMP19021 973 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TAF6P49848 677 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ETV1P50549 477 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TFDP2Q14188 446 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 DNAAF3Q8N9W5 541 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TRPC4APQ8TEL6 797 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MTERF3Q96E29 417 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 THAP9Q9H5L6 903 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CHRAC1Q9NRG0 131 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MTRRQ9UBK8 725 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 DNAJB4Q9UDY4 337 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 NFU1Q9UMS0 254 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 GDAQ9Y2T3 454 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MED16Q9Y2X0 877 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 GIT1Q9Y2X7 761 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 COQ6Q9Y2Z9 468 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 FADS2P1A8MWK0 482 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CCRL2O00421 344 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF197O14709 1029 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PSMD3O43242 534 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 DLGAP3O95886 979 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SLC4A1P02730 911 aa6.5□□□□□ -1.37
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